软磁盘的文件系统是FAT12，0～1个扇区是引导扇区，1～9和10～18是两个相同的FAT表，后面是根目录区（每个条目占32字节）和数据区。
其中FAT表每项占12位，代表一个簇，第0，1个FAT项始终不使用。第二项开始表示数据区的每个簇，在文件较小，没有跨越扇区的情况FAT基本没用，FAT中保存的是文件下一个簇号（扇区），如果大于或者等于0xFF8则表示是本文件最后一个簇，如果等于0xFF7，表示一个坏簇。