由于前不久docker hub封禁问题导致下载受限,十分不便,所以自己做了镜像包。
资源介绍:
功能:ngs-bits 2024-08-88 ()
系统:2024.04版本的ubuntu系统
通过百度网盘分享的文件:ngs-bits2024_08-88.tar.gz
链接:https://pan.baidu.com/s/1_a9qNjVVHGkh7iM7CEnExQ
提取码:vcj7
ngs-bits的性别判断模块:SampleGender
# 创建idx
samtools index sample.sorted.bam
# 1)基于xy染色体 reads数量
SampleGender -in sample.sorted.bam -method xy -build hg19 >
# 2)基于x染色体上杂合位点的比例
SampleGender -in sample.sorted.bam -method hetx -build hg19
# 3)基于Y染色体sry基因的覆盖度
SampleGender -in sample.sorted.bam -method sry -build hg19
#