ngs-bits:性别检测

由于前不久docker hub封禁问题导致下载受限,十分不便,所以自己做了镜像包。

资源介绍:
功能:ngs-bits 2024-08-88 ()
系统:2024.04版本的ubuntu系统

通过百度网盘分享的文件:ngs-bits2024_08-88.tar.gz
链接:https://pan.baidu.com/s/1_a9qNjVVHGkh7iM7CEnExQ
提取码:vcj7

ngs-bits的性别判断模块:SampleGender

# 创建idx 
samtools index sample.sorted.bam 

# 1)基于xy染色体 reads数量 
SampleGender -in sample.sorted.bam -method xy -build hg19 > 

# 2)基于x染色体上杂合位点的比例 
SampleGender -in sample.sorted.bam -method hetx -build hg19 

# 3)基于Y染色体sry基因的覆盖度 
SampleGender -in sample.sorted.bam -method sry -build hg19 
#


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