第一部分，先说证书的申请。
这步是要到正规的CA公司申请正式的设备证书必须走的步骤。
1、先生成证书的密钥对
打开命令行，切换到某个自己新建的目录下，执行如下命令
keytool -genkey -keyalg RSA -keysize 1024 -dname “CN=www.javastar.org,OU=翊天阁,O=翊天阁,L=南京市,ST=江苏省,C=CN” -alias server -keypass 123456 -keystore server.jks -storepass 123456 -validity 365
这里说明一下几个重要的地方,CN=www.javastar.org，这里的www.javastar.org一定要换成你实际要部署的站点的域名，如果是在内网，就要用服务器的hostname，一定不可以用IP，否则，是无法建立SSL链接的。
OU=翊天阁,O=翊天阁，这里可以替换成你自己的组织名称，或者公司名称。
-validity 365这里声明证书有效期为1年。
其他的参数自己可以参考keytool的使用帮助或相关文档。
好了，成功执行上面的命令后，我们在当前命令行所在目录得到server.jks文件，这个就是包含密钥对的基本证书信息库文件。
2、导出证书请求文件
keytool -certreq -alias server -sigalg “SHA1withRSA” -file server.pem -keypass 123456 -keystore server.jks -storepass 123456
这里可以得到一个server.pem的文件。
3、向CA公司申请签发设备证书
将上一步得到的server.pem证书发送给相关的CA公司，CA公司会通过这个申请签发一张设备证书，最后我们会得到一个.cer的文件，比如server.cer。
同时，我们要取得该CA公司的证书链，比如会有CA_ROOT.cer和CA_CA.cer，第一张为CA公司的根证书，第二张为CA公司的签名证书。
4、将CA根证书导入服务器证书库
keytool -import -alias CA_ROOT -keystore server.jks -trustcacerts -storepass 123456 -file CA_ROOT.cer
5、将CA签名证书导入服务器证书库
keytool -import -alias CA_CA -keystore server.jks -trustcacerts -storepass 123456 -file CA_CA.cer
6、使用CA签发的证书回复我们自己生成的包含私钥的证书
keytool -import -alias server -keystore server.jks -trustcacerts -storepass 123456 -file server.cer
7、导出回复成功后的服务器证书
keytool -export -alias server -storepass 123456 -file javastar.org.cer -keystore server.jks
好了，到这里我们需要的设备证书已经ok了。
最后对我们实际有用的是两个文件：server.jks，是服务器证书库，存储了含有私钥的服务器证书，及其证书链，这个就是主要的设备证书了，是放在服务器的SSL配置里面；还有一个是javastar.org.cer，这个是只包含服务器证书公钥的设备证书，是发给用户，让用户放入自己的可信任库的。
第二部分，配置Tomcat的SSL双向链接
1、准备客户端证书
keytool -genkey -v -alias client -keyalg RSA -storetype PKCS12 -keystore client.p12 -dname “CN=Client,OU=javastar.org,L=nj,ST=js,C=cn” -storepass 123456 -keypass 123456 -validity 365
执行完毕，我们会得到一张p12的客户证书client.p12。
2、导出.cer格式的客户证书
keytool -export -alias client -keystore client.p12 -storetype PKCS12 -storepass 123456 -rfc -file client.cer
执行完毕得到client.cer证书。
3、将客户端证书导入服务器的可信任证书库
keytool -import -v -file client.cer -keystore servertrust.keystore -storepass 123456
执行完毕得到servertrust.keystore，这个是给tomcat服务器端用的。
4、将服务器证书导入客户端可信任证书库
keytool -import -v -file javastar.org.cer -keystore clienttrust.keystore -storepass 123456
执行完毕会得到clienttrust.keystore证书库，留着备用。同时，也可以同样的方法，把CA_ROOT.cer和CA_CA.cer导入。
5、在和tomcat的bin目录并行的目录下新建一个cert文件夹，把server.jks和servertrust.keystore文件拷贝进去。
6、找到tomcat的server.xml文件，找到如下的内容
<!–
<Connector port=”8443″ protocol=”HTTP/1.1″ SSLEnabled=”true”
maxThreads=”150″ scheme=”https” secure=”true”
clientAuth=”false” sslProtocol=”TLS” />
–>
去掉注释，并修改为
<Connector port=”8443″ protocol=”HTTP/1.1″ SSLEnabled=”true”
maxThreads=”500″ scheme=”https” secure=”true”
clientAuth=”true” sslProtocol=”TLS”
keystoreFile=”D:/apache-tomcat-6.0.20/cert/server.jks” keystorePass=”123456″
truststoreFile=”D:/apache-tomcat-6.0.20/cert/servertrust.keystore” truststorePass=”123456″/>
这里注意把D:/apache-tomcat-6.0.20/cert修改为你的tomcat实际的路径。
7、启动或者重启tomcat，在浏览器中导入client.p12的证书，然后，在地址栏输入https://www.javastar.org:8443，就会弹出证书选择框，选择证书后，就可以使用SSL协议访问tomcat服务器了。
第三部分，在程序中如何建立与服务器的SSL双向认证链接
其实这个就简单了，以java为例，比如我们现在要访问一个通过SSL双向认证保护的WebService接口，只需要在生成的客户端程序中开始部分加入
System.setProperty(“javax.net.ssl.keyStore”, “D:/client.p12″);
System.setProperty(“javax.net.ssl.keyStorePassword”, “123456″);
System.setProperty(“javax.net.ssl.keyStoreType”, “PKCS12″);
System.setProperty(“javax.net.ssl.trustStore”, “D:/clienttrust.keystore”);
System.setProperty(“javax.net.ssl.trustStorePassword”, “123456″);
System.setProperty(“javax.net.ssl.trustStoreType”, “JKS”);
JVM会自动将证书提交给服务器验证，由于服务器证书也在我们的可信任库，也会自动信任服务器端的证书。
下面的代码可以在需要的时候清除以上的环境内容
System.clearProperty(“javax.net.ssl.keyStore”);
System.clearProperty(“javax.net.ssl.keyStorePassword”);
System.clearProperty(“javax.net.ssl.keyStoreType”);
System.clearProperty(“javax.net.ssl.trustStore”);
System.clearProperty(“javax.net.ssl.trustStorePassword”);
System.clearProperty(“javax.net.ssl.trustStoreType”);