局部引用：
JNI 函数内部创建的 jobject 对象及其子类( jclass 、 jstring 、 jarray 等) 对象都是局部引用，它们在 JNI 函数返回后无效；
一般情况下，我们应该依赖 JVM 去自动释放 JNI 局部引用；但下面两种情况必须手动调用 DeleteLocalRef() 去释放：
(在循环体或回调函数中)创建大量 JNI 局部引用，即使它们并不会被同时使用，因为 JVM 需要足够的空间去跟踪所有的 JNI 引用，所以可能会造成内存溢出或者栈溢出;
如果对一个大的 Java 对象创建了 JNI 局部引用，也必须在使用完后手动释放该引用，否则 GC 迟迟无法回收该 Java 对象也会引发内存泄漏.
全局引用：
全局引用允许你持有一个 JNI 对象更长的时间，直到你手动销毁；但需要显式调用 NewGlobalRef() 和 DeleteGlobalRef() ：
class MyPeer {
private:
jstring s;
public:
MyPeer(JNIEnv* env, jstring s) {
this->s = env->NewGlobalRef(s);
}
~MyPeer() {
env->DeleteGlobalRef(s);
s = NULL;
}
};
弱全局引用
弱全局引用类似 Java 中的弱引用，它允许对应的 Java 对象被 GC 回收；
类似地，创建和释放也是通过 NewWeakGlobalRef() 和 DeleteWeakGlobalRef() ；
调用 IsSameObject(env, jobj, NULL) 可以判断该弱全局引用指向的 Java 对象是否已被 GC 回收。
jobject 对象的引用值不唯一
同一个 jobject 对象的不同引用可能拥有不同的值，比如同一 jobject 对象每次调用 NewGlobalRef() 可能返回不同的值；
要检查两个引用是否指向同一个 jobject 对象，必须调用 IsSameObject() ，而不要使用 == 去比较；
用于描述一个 jobject 对象的 32 位值可能在方法多次调用后发生变化，而两个不同 jobject 对象却可能在多次方法调用拥有相同的值，所以千万不能将 jobject 对象的值当作 key 使用；
jmethodID 和 jfieldID:
在 JNI 层执行 Java 代码常用到 FindClass() 、 GetMethodID() 、 GetFieldID() ；
但只有第一个函数返回的 jclass 属于 JNI (局部)引用对象，而 jmethodID 和 jfieldID 并不是，它们是指向内部 Runtime 数据结构的指针；
实际上这些 ID 是用于缓存的静态对象：第一次查找会做一次字符串比较，但后面再次调用就能直接读取而变得很快；
JVM 会保证这些 ID 是合法的，直到 Class 被 unload；
所以， jmethodID 和 jfieldID 是不需要手动释放的，当然也不能作为 JNI 全局引用。
其他非 JNI 引用:
除了上面提到的 ID，类似 GetStringUTFChars() 和 GetByteArrayElements() / GetCharArrayElements() 等函数返回的也是 Raw Data 指针，而非 JNI 引用；
在调用相对应的 ReleaseXXX() 函数释放前，它们都是合法的；
批量操作 JNI 引用:
一般情况下要避免大量创建 JNI 局部引用，最好用完后立即释放（实际上目前的实现只预留了 16 个局部引用的空间);
如果确实需要大量操作 JNI 局部引用，要么调用 EnsureLocalCapacity() 指定更多的空间，要么调用 PushLocalFrame() / PopLocalFrame() 批量分配/释放：
env->PushLocalFrame(128);
jobjectArray array = env->NewObjectArray(128, gMyClass, NULL);
for (int i = 0; i < 128; ++i) {
env->SetObjectArrayElement(array, i, newMyClass(i));
}
env->PopLocalFrame(array);
开启 CheckJNI 检查 JNI 引用问题:
Android 提供了一种叫做 CheckJNI 的模式用于检测常见的 JNI 错误，其中和 JNI 引用相关的错误有：
将
DeleteGlobalRef()/DeleteLocalRef()用于错误的 JNI 引用类型；jfieldID/jmethodID为空或者类型不合法；
但是 CheckJNI 暂时还不能检测 JNI 局部引用的滥用问题，比如：存储了一个 JNI 局部引用，然后在 JNI 函数返回后继续使用。这种情况很显然应该使用 NewGlobalRef() 创建全局 JNI 引用。
开启 CheckJNI 只需一行命令即可：
adb shell setprop debug.checkjni 1
参考 ：