Dictionaries in fmriprep when preprocession was done are follows:
1.Visual QA (quality assessment) reports
2.Derivatives (preprocessed data) derivative 衍生物
3.Confounds
具体而言:
1.可视化报告:
位于fmriprep下面的subXX.html文件,展示了该被试进行的所有处理及方式和参数,可以copy至article中。
2.fmriprep衍生物
每一个被试文件夹会有如下衍生物:
1-衍生物 anat
2-衍生物 freesurfer
fsaverage如果任何功能数据被采样到这些主题空间,则随 FreeSurfer 运行版本分发的主题副本将复制到此主题目录中。
3-衍生物 func
以及来自 FreeSurfer 的表面、分割和分割
aparc 是皮层分割,aseg是皮层下分割。表面输出空间包括fsnative(全密度主题特定网格) fsaverage和下采样网格fsaverage6(41k 顶点)和 fsaverage5(10k 顶点,默认)。
以及_[specifiers]_bold.dtseries.nii,即灰度文件。
时间序列的混淆矩阵desc-confounds_timeseries.tsv
ICA-AROMA的参数
3.confounds 不重要
After the preprocess of fmriprep in dpabisurf, it will generate several dictionaries, including fmriprep, fmriprepwork, freesurfer.
1.fmriprep:
上面提到的fmriprep文件都会有,主要关注subXX.html文件
2.fmriprepwork:
不重要,忽略
3.freesurfer:
sub-sub061:
fsaverage:
fsaverage5: