R语言学习笔记(五)绘图(1)

  R是一个惊艳的图形构建平台,这也是R语言的强大之处。本文将分享R语言简单的绘图命令。

  本文所使用的数据或者来自R语言自带的数据(mtcars)或者自行创建。

  首先,让我们来看一个简单例子:

dose <- c(20, 30, 40, 45, 60)
drugA <- c(16,20,27,40,60)
plot(dose, drugA)

绘制的图形如下:

![这里写图片描述](http://img.blog.csdn.net/20180116212628077?watermark/2/text/aHR0cDovL2Jsb2cuY3Nkbi5uZXQvamNsaWFuOTE=/font/5a6L5L2T/fontsize/400/fill/I0JBQkFCMA==/dissolve/70/gravity/SouthEast)

  我们有必要对上述代码做些说明:首句和第二条语句创建两个向量,第三条语句打开一个图形窗口并生成一幅散点图。

  这也许是个极为简单的例子,因为并没有涉及到太多其他关于图形参数(如符号与线条,颜色,文本属性,图形尺寸和边界大小等)方面的知识。接下来,我们将在此基础上讲讲图形参数的设置。

1.1 符号与线条

if(FALSE){该例展示如何利用par函数修改图形参数}
dose <- c(20, 30, 40, 45, 60)
drugA <- c(16,20,27,40,60)
if(FALSE){no.readonly=TRUE可以生成一个可以修改的当前图形参数列表}
opar <- par(no.readonly = TRUE)
if(FALSE){虚线+实三角}
par(lty=2, pch=17)
if(FALSE){b表示绘制点和线}
plot(dose, drugA, type="b")
par(opar)

绘制的图形如下:

![这里写图片描述](http://img.blog.csdn.net/20180116212709904?watermark/2/text/aHR0cDovL2Jsb2cuY3Nkbi5uZXQvamNsaWFuOTE=/font/5a6L5L2T/fontsize/400/fill/I0JBQkFCMA==/dissolve/70/gravity/SouthEast)

上述代码中的图形参数设置也可以通过键值对来实现,并不需要par()函数,如下:

```R
dose

  • pch:绘制点时使用的符号(范围:0~25);
  • cex:绘制符号的大小(默认值为1);
  • lty:线条类型(范围1~6);
  • lwd:线条宽度(默认值为1);
  • 1.2 颜色

      R语言图形的颜色参数常用如下:

    • col:默认绘图颜色;
    • col.axis:坐标轴刻度文字的颜色;
    • col.lab:坐标轴标签的颜色;
    • col.main:标题的颜色;
    • col.sub:副标题的颜色;
    • fg:图形的前景色;
    • bg:图形的背景色;

      在R中,可以通过颜色下标、颜色名称、十六进制的颜色值、RGB值或HSV值来指定颜色。例如,col=1,col="white",col="#FFFFFF",col=rgb(1,1,1)和col=hsv(0,0,1)都表示白色。

      示例代码:

    dose <- c(20, 30, 40, 45, 60)
    drugA <- c(16,20,27,40,60)
    opar <- par(no.readonly = TRUE)
    par(lty=2,pch=17,col.axis=2,fg=rgb(0,0,1),bg='gray')
    plot(dose,drugA,type="b")
    par(opar)

    绘制的图形如下:

    ![这里写图片描述](http://img.blog.csdn.net/20180116212755086?watermark/2/text/aHR0cDovL2Jsb2cuY3Nkbi5uZXQvamNsaWFuOTE=/font/5a6L5L2T/fontsize/400/fill/I0JBQkFCMA==/dissolve/70/gravity/SouthEast)

    1.3 文本属性

      R语言图形的文本大小参数如下:

    • cex:相对于默认大小缩放倍数的数值;
    • cex.axis:坐标轴刻度文字的缩放倍数;
    • cex.lab:坐标轴标签的缩放倍数;
    • cex.main:标题的缩放倍数;
    • cex.sub:副标题的缩放倍数;

      R语言图形的字体族、字号和字样的参数如下:

    • font:绘图时使用的字体样式(整数,范围:1~5);
    • font.axis:坐标轴刻度文字的字体样式;
    • font.lab:坐标轴标签的字体样式;
    • font.main:标题的字体样式;
    • font.sub:副标题的字体样式;
    • ps:字体磅数(最终大小为:ps*cex)
    • family:绘制文本时使用的字体族;

      示例代码:

    dose <- c(20, 30, 40, 45, 60)
    drugA <- c(16,20,27,40,60)
    opar <- par(no.readonly = TRUE)
    par(lty=2,pch=17,cex.axis=2, font.lab=4 )
    plot(dose,drugA,type="b")
    par(opar)

    绘制的图形如下:

    ![这里写图片描述](http://img.blog.csdn.net/20180116212824928?watermark/2/text/aHR0cDovL2Jsb2cuY3Nkbi5uZXQvamNsaWFuOTE=/font/5a6L5L2T/fontsize/400/fill/I0JBQkFCMA==/dissolve/70/gravity/SouthEast)

    1.4 图形尺寸和边界大小

      R语言图形的控制图形尺寸和边界大小参数如下:

    • pin:以英寸表示的图形尺寸(宽和高);
    • mai:数值向量表示边界大小,顺序为“下左上右”,单位为英寸;
    • mar:数值向量表示边界大小,顺序为“下左上右”,单位为英分;

      示例代码:

    dose <- c(20, 30, 40, 45, 60)
    drugA <- c(16,20,27,40,60)
    opar <- par(no.readonly = TRUE)
    par(pin=c(3,2))
    plot(dose,drugA,type="b")
    par(opar)

    绘制的图形如下:

    ![这里写图片描述](http://img.blog.csdn.net/20180116212912294?watermark/2/text/aHR0cDovL2Jsb2cuY3Nkbi5uZXQvamNsaWFuOTE=/font/5a6L5L2T/fontsize/400/fill/I0JBQkFCMA==/dissolve/70/gravity/SouthEast)

      接下来的部分虽然不属于图形参数,但对于图形来说依然十分重要!为了保持叙述流畅,将沿用上面的序号。

    1.5 坐标轴、标题

      R语言的图形坐标轴选项如下:

    • xlab:x轴标签;
    • ylab:y轴标签;
    • xlim:x轴范围;
    • ylim:y轴范围;

      标题选项如下:

    • main:主标题;
    • sub:副标题;
    • title():函数,可添加坐标轴标签和标题;

      示例代码:

    dose <- c(20, 30, 40, 45, 60)
    drugA <- c(16,20,27,40,60)
    plot(dose,drugA,type="b",
    xlab='x:dose',ylab='y:drugA',
    xlim=c(20,60),ylim=c(15,60),
    main='drugA over dose',sub='As exmaple')

    绘制的图形如下:

    ![这里写图片描述](http://img.blog.csdn.net/20180116212944512?watermark/2/text/aHR0cDovL2Jsb2cuY3Nkbi5uZXQvamNsaWFuOTE=/font/5a6L5L2T/fontsize/400/fill/I0JBQkFCMA==/dissolve/70/gravity/SouthEast)

    1.6 自定义坐标轴、文本标注、参考线

      自定义坐标轴(axis)的参数如下:

    • side:1=下,2=左,3=上,4=右;
    • at:数值型向量,表示绘制刻度线的位置;
    • labels:字符型向量,表示刻度线旁边的文字标签;
    • pos:坐标轴线绘制位置的坐标;
    • lty:线条类型;
    • col:线条和刻度线的颜色;
    • las:标签是否平行于(=0)或垂直于(=2)坐标轴
    • tck:刻度线的长度;
    • ...

      R语言的文本标注有text()和mtext(),其中text()可向绘图区域内部添加文本,mtext()则向图形的四个边界之一添加文本,它们的参数如下

    • location:文本的位置参数,可用(x,y)坐标,也可交互式添加;
    • pos:文本相对于位置参数的方位,1=下,2=左,3=上,4=右。
    • side:放置文本的边,1=下,2=左,3=上,4=右;

    其他常用的选项有cex,col和font(分别来调整字号、颜色和字体样式)。R语言还支持数学标注,标注语法类似于Tex.

      参考线的函数为abline(),语法为:

    abline(h=yvalues, v=xvalues)

    abline()中也可以指定其它图形参数,如线条类型、颜色和宽度。

      示例代码:

    x <- c(1:10)
    y <- x
    z <- 10/x
    opar <- par(no.readonly = TRUE)
    if(FALSE){边界大小}
    par(mar=c(5,4,4,8)+0.1)
    plot(x,y,type="b",pch=21,col="red",yaxt="n",lty=3,ann = FALSE)
    lines(x,z,type="b",pch=22,col="blue",lty=2)
    if(FALSE){自定义坐标轴}
    axis(2,at=x,labels=x,col.axis="red",las=2)
    axis(4,at=z,labels=round(z,digits=2),col.axis="blue",las=2,cex.axis=0.7,tck=-0.01)
    if(FALSE){文本标注}
    mtext("y=10/x",side=4,line=3,cex.lab=1,las=2,col="blue")
    if(FALSE){标题+坐标轴标签}
    title("An Example of Creative Axes", xlab="X values",ylab="Y=X")
    if(FALSE){参考线}
    abline(h=seq(1,10,2), lty=2, col="blue")
    par(opar)

    绘制的图形如下:

    ![这里写图片描述](http://img.blog.csdn.net/20180116213022792?watermark/2/text/aHR0cDovL2Jsb2cuY3Nkbi5uZXQvamNsaWFuOTE=/font/5a6L5L2T/fontsize/400/fill/I0JBQkFCMA==/dissolve/70/gravity/SouthEast)

    1.7 图例

      R语言中的图例函数为legend(),参数如下:

    • location:指定(x,y)坐标,或使用关键字(如:topleft),或交互式指定位置;
    • title:图例标题的字符串(可选);
    • legend:图例标签组成的字符型向量;
    • ...

    其它选项还包括:指定盒子样式的bty,背景色:bg,大小:cex,文本颜色:text.col等。

      示例代码如下:

    dose <- c(20,30,40,45,60)
    drugA <- c(16,20,27,40,60)
    drugB <- c(15,18,25,31,40)
    opar <- par(no.readonly = TRUE)
    par(lwd=2, cex=1.5, font.lab=2)
    plot(dose,drugA,type="b",pch=15,lty=1,col="red",ylim=c(0,60),
    main="Drug A vs. Drug B",xlab="Drug Dosage",ylab="Drug Response")
    lines(dose,drugB,type="b",pch=17,lty=2,col="blue")
    legend("topleft",inset=.05,title="Drug Type",c("A","B"),lty=c(1,2),pch=c(15,17),col=c("red","blue"))
    par(opar)

    绘制的图形如下:

    ![这里写图片描述](http://img.blog.csdn.net/20180116213439137?watermark/2/text/aHR0cDovL2Jsb2cuY3Nkbi5uZXQvamNsaWFuOTE=/font/5a6L5L2T/fontsize/400/fill/I0JBQkFCMA==/dissolve/70/gravity/SouthEast)

    1.8图形的组合

      在R语言中,可用函数par()或layout()组合多幅图形为一幅总括图形。在par()函数中可用mfrow=c(nrows,ncols)来创建按行填充的、行数为nrows、列数为ncols的图形矩阵。layout()的调用形式为layout(mat),其中mat为矩阵,制定了组合的多个图形的所在位置,可以跨行或跨列。

      示例代码1如下:

    attach(mtcars)
    opar <- par(no.readonly = TRUE)
    par(mfrow=c(2,2))
    plot(wt,mpg,main="scatterplot of wt vs. mpg")
    plot(wt,disp,main="scatterplot of wt vs. disp")
    hist(wt,main="Histogram of wt")
    boxplot(wt,main="boxplot of wt")
    par(opar)
    detach(mtcars)

      绘制的图形如下:

    ![这里写图片描述](http://img.blog.csdn.net/20180116212132142?watermark/2/text/aHR0cDovL2Jsb2cuY3Nkbi5uZXQvamNsaWFuOTE=/font/5a6L5L2T/fontsize/400/fill/I0JBQkFCMA==/dissolve/70/gravity/SouthEast)

      示例代码2如下:

    attach(mtcars)
    layout(matrix(c(1,1,2,3),2,2,byrow=TRUE),widths = c(3,1),heights = c(1,2))
    hist(wt)
    hist(mpg)
    hist(disp)
    detach(mtcars)

      绘制的图形如下:

    ![这里写图片描述](http://img.blog.csdn.net/20180116212039975?watermark/2/text/aHR0cDovL2Jsb2cuY3Nkbi5uZXQvamNsaWFuOTE=/font/5a6L5L2T/fontsize/400/fill/I0JBQkFCMA==/dissolve/70/gravity/SouthEast)

      以上的内容参考自《R语言实战》。关于图形的设置就讲到这儿了,终于可以舒一口气了~~下面我们将尝试着自己来绘制图形

      我们将要绘制的图形来自于:http://www.runoob.com/try/try.php?filename=HighchartsTest ,这个图形使用HighCharts绘制的,我们将用R语言来绘制这个图形。代码如下:

    x <- seq(1,12)
    months <- c('一月','二月','三月','四月','五月','六月','七月','八月','九月','十月','十一月','十二月')
    Tokyo <- c(7.0,6.9,9.5,14.5,18.2,21.5,25.2,26.5,23.3,18.3,13.9,9.6)
    New_York <- c(-.2,.8,5.7,11.3,17.0,22.0,24.8,24.1,20.1,14.1,8.6,2.5)
    Berlin <- c(-.9,.6,3.5,8.4,13.5,17.0,18.6,17.9,14.3,9.0,3.9,1.0)
    London <- c(3.9,4.2,5.7,8.5,11.9,15.2,17.0,16.6,14.2,10.3,6.6,4.8)
    opar <- par(no.readonly = TRUE)
    par(bty="n")
    plot(Tokyo,xaxt="n",pch=19,type="b",lwd=2,
    main="月平均气温",sub="Plotted by R Language",
    ylim=c(-10,30),col="blue",xlab="",ylab="Temperature(℃)",axes=FALSE)
    lines(New_York,type="b",pch=18,col="black",lwd=2)
    lines(Berlin,type="b",pch=15,col="green",lwd=2)
    lines(London,type="b",pch=17,col="orange",lwd=2)
    axis(2,at=seq(-10,30,10),tick=F)
    axis(1,at=x,labels=months,las=2)
    abline(h=c(0,10,20,30),col="gray")
    legend("topright",c("Tokyo","New York","Berlin","London"),pch=c(19,18,15,17),
    col=c("blue","black","green","orange"),bty="n")
    par(opar)

    绘制的图形如下:

    ![模拟HighCharts的绘图](http://img.blog.csdn.net/20180116211910179?watermark/2/text/aHR0cDovL2Jsb2cuY3Nkbi5uZXQvamNsaWFuOTE=/font/5a6L5L2T/fontsize/400/fill/I0JBQkFCMA==/dissolve/70/gravity/SouthEast)

      本次分享到此结束,欢迎大家交流~~

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