RNA Sequencing
国内领先的转录组定序基地
Transcriptome Sequencing可全面性并快速地获得某一物种特定细胞或组织在某一状态下的几乎所有的转录体(transcriptome)及基因序列,可以用于研究物种基因结构和基因功能、选择性剪接和新的转录序列(transcript)预测等。针对转录体定序研究,与全基因体定序研究一样,可分为两种类型:一种未知参考序列 (No Referenece Genome)的物种转录体定序;另一种则是已具有参考序列的物种转录体定序(例如:人类、水稻)。而相对于传统微阵列晶片(microarray),转录体定序无须预先针对已之序列设计探针(probe),即可对任意物种的转录体进行监测,不但可以提供高精确度的量化信号,且具有高通量与高灵敏度等特性,是深入研究转录体的强大工具。
目前,RNA Sequencing已经被广泛应用于动植物优良基因筛选以及疾病研究等方面。有劲生技利用标准化的实验流程、先进的定序平台与专业的生物资讯分析打造出国内领先的转录体定序实验室,以高效率、高质量的科技服务赢得专业人士的良好口碑。
适用研究目的
- 侦测基因表现量。
- mRNA选择性剪切型态。
究物种基因结构和基因功能、选择性剪接和新的转录序列(transcript)预测等
范例报告
RNA Sequencing。如有任何疑问,欢迎致电/来信指教。
建议策略
产品
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mRNA Sequencing |
常见研究目的
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研究物种基因结构和基因功能、选择性剪接和新的转录序列(transcript)预测 |
建议定序规格
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*定序平台:Proton/Illumina *定序方式:Single-End/Paired-End *定序长度:100-300pb |
建议定序资料量/定序深度
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5G |
特殊限制
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需有参考序列(Reference sequence) |
样品需求规格
生资分析流程
样品类别
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定序项目
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分析层级
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生物资讯分析策略
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RNA
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RNA sequencing
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Basic
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● Quality trim |
● Mapping to reference genome |
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● Gene expression |
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Advanced
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● Quality trimmed |
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● Mapping to reference genome |
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● Gene expression |
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● Differential expression analysis |
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● GO analysis for genes with significantly different expression level |
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● KEGG metabolic pathways for genes with significantly different expression level |