在利用gromacs进行动力学模拟过程中,添加离子时出现报错信息:
Fatal error:No line with moleculetype ‘SOL’ found the [molecules] section of the file ‘topol.top’
而检查文件时发现topol.top正常。
此时原因可能是由于拓扑文件在windows系统下处理过,行尾标记有问题。
解决方案:用dos2unix工具处理一下拓扑文件。
转化之后便可运行成功。
参考资料:
dos2unix命令的使用:https://www.cnblogs.com/luo*/p/3387542.html