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SAP analysis in the Ohmega software

ohmega software 关于胃食管反流疾病 对 sap的分析方法 分享。 sap 是描述 胃食管反流仪器对患者监测时，出现的症状如：咳嗽 烧心 胸痛 等症状 与反流相关的概率。这个概率大于0.95说明该症状是反流引起的。 sap需借助 Fisher Exact test 分析方法来进行分析。这个方法的表现形式如下表： C1和C2描述的是两个条件，-C1 -C2 表达的意思就是没有符合C1 C2这两个条件的情况。字母a表示，C1和C2都满足的情况；b表示，C1 -C2表示只满足C1，不满足C2；c表示，C1条件不满足但C2条件满足；d表示，C1 C2条件都不满足的情况次数。这里的A+c应该是等同于a+c的。 有了这个表格，就能计算除C2条件因为C1条件发生的概率也就是sap。 首先计算 p： 然后sap=（1-p)*100%,在这款软件的含义是：如果sap>0.95就说明症状和反流存在关联性。 在计算胃食管反流的时候，我们把C1当作反流，C2当作某种症状。 R是反流英文 Reflux的首字母，这里就代表反流条件，S是症状 Symptoms的首字母这里代表某种症状条件。 S+R+表示既有反流又有症状 ，S-R+表示只有反流没有症状，S+R-表示只有症状没有反流，S-R-表示症状和反流都没有。这里只是很笼统的说一下其大概意思，但是详细定义S+R+这些计算方法如下： 我们是把软件检测时间分成每2分钟一段，然后分成S-和S+及这样分成的每段的无症状情况和有症状情况讨论。先说S-及无症状段情况。 接下图： R+=3的解释，我的理解是，R1所处的这2分钟段没有出现症状，算一次，R2 和R3所处的段也没有出现症状S，算一次， R4所处的段也没有，所以总共三次，在计算S-时，是数的段数而不是出现的反流次数。与S+的情况有区别。 R-=5的解释，我的理解是，没有出现竖着的虚线标记的段有5个所以是5次。 如果软件设置了排除进食区域，这种情况如图： Meal period 的占用部分不算。 S+的情况 For R+S+ and R-S+ we look 2 minutes in front of each symptom. When a start of a reflux is within this two minute period this period is said to be R+S+ and else it is categorized as R-S+. 我的翻译是，当症状出现了，往症状的出现前的前2分钟找，如果在这段时间内有一次反流就S-R+算一次，如果没有反流就R-S+算一次，需要排除已经算过的反流情况。 R+=3，我的理解是，R1在s1算一次，在s2算一次，但是s1已经算过了，s2那次就不算了。对于S3 有R2和R3两次。所以总共3次。 R-=1，我的理解是，S4前两分钟没有出现反流，所以算一次。 排除进食区域的情况： R+=2，R1算一次，R3算一次，R2就不算了。 总体来看，就是这样。 但是本来总共只有8个两分钟段，但这里计算得出的总数是12，有些反流是被重复计算了，因为在S-和S+的计算情况不一样造成的，所以 我们要： S-R+=S-R+ - S+R+及 3-3=0 s-R-=S-R- - S+R-及5-1=4 结果如下表： 但是明显S-R+不应该为0，有一个R4。造成这样的原因是，在算S+R+时，R2和R3所处的段被多算了一次，意思是本来S+R+的段只有2个，但因为S+计算方式不同，所以多算一个。 还有S-R-只有2个，但这里是4，是因为计算症状和反流的时间有重叠，造成了不一致，就多出来了，我觉得从图上看是看不出来的吧。