这个问题发生是因为不同操作系统的行结束符不一致导致的，可在clone之后在仓库根目录修改.gitattributes文件

简单处理的话，注释* text=auto这行即可。也可根据不同系统，做相应设定

http://*.com/questions/5009096/files-showing-as-modified-directly-after-git-clone

https://help.github.com/articles/dealing-with-line-endings/