通常修改包名时会造成R文件错误，并且有时带有原因不明的Manifest文件中多处文本混乱。
所以，将目前认为最为简洁方便的修改包名流程记录如下：
假设我们目前的包名为com.pepper.util，我们将要把包名修改为com.pp.util
1、点击项目右击——>Android Tools——>rename application package：修改好包名——>点击OK——>点击finish：Launch configuration update——>点击Yes
2、假设你的包名为：com.pepper.util，先不要修改主包的包名。你在这个包下又建立了几个子包，如：com.pepper.util.print，现在我们首先修改子包的包名为：com.pp.util.print。在子包的位置单击鼠标右键——>Refactor——>Rename，之后会弹出以下对话框：
如图设置后，点击Preview——>点击OK。
3、子包都修改好之后，打开Manifest文件，将Manifest中关于原来包名的com.pepper.util字样，全部修改为com.pp.util，修改完保存。
4、按照第2步的方法修改主包的包名。中间会比第2步多一个步骤，点击continue即可。
5、现在包名都已经修改好了，但是程序中可能还是会有一些不能自动修改的地方包名可能还是com.pepper.util，所以我们要搜索整个项目，看看是否还有存在原来包名的地方。现在点击整个项目，然后按快捷键Ctrl+H，会弹出以下界面：
选择上面的标签：File Search，在Containing text:中输入你原来包名或原来包名与现在包名不同的部分，我们现在就搜索pepper，然后点击Search。在eclipse的下面的部分会有带有Search标签的窗体显示，其中的内容就是搜索的结果，如果项目中仍然存在原来包名字样，则会在这里显示，点击具体显示的位置，然后将其修改为现在的包名。修改完保存。
6、现在整个项目的包名已经修改完成啦。