虽然 MSE 很出色，但是用户在选择时还是需要注意几点问题的。首先，MSE 是单机版，这意味着不支持网络集中化的管理。其次，MSE 的安装格式是 EXE，并且不支持命令行安装，即使使用压缩软件将其解包获得的 MSI 也无法进行命令行的安装，那么也就不支持无人值守的自动化安装。最后，MSE 不支持 IE Proxy 方式，也就是说如果联网只支持 IE Proxy，那么你将无法进行在线更新，必须手工下载更新文件进行安装。

        以上三点我们可以看出，MSE 虽然免费出色，但是却不完全适合企业部署使用。如果企业要考虑降低成本，选择 MSE 可要多加考虑考虑。