> source("http://bioconductor.org/biocLite.R") > biocLite("rhdf5")
但是这样会自动连国外的服务器下载安装所需的软件包。而我的改进方法如下:
1、用浏览器访问http://bioconductor.org/biocLite.R,将文件保存到本地
2、编辑本地的biocLite.R, 将第三行和第八行的注释符去掉,内容改为:
options("repos" = c(CRAN="http://mirror.bjtu.edu.cn/cran")) options("BioC_mirror" = "http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")这样就会连国内的服务器下载包,速度会比较快。
3、在R中运行
> source("biocLite.R") > biocLite("rhdf5")
即可安装rhdf5包。
另外安装时可能碰到报错:installed directory not writable,cannot update packages...
我的解决办法是以管理员身份启动R运行环境或RStudio,再进行安装。
Win7中(RHDF5)bioConduct安装技巧及installed directory not writable问题解决