在写了本系列的前面几篇文章之后。有些网友质疑文章的正确性。在仔细的推敲之下,这些网友指正的不无道理。下面举一个反例,来质疑前面文章的正确性。
文本:A:481234781;B:4411327431
先按照LD算法,计算LD矩阵
4 | 4 | 1 | 1 | 3 | 2 | 7 | 4 | 3 | 1 | ||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
0 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 | 10 | |
4 | 1 | 0 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 |
8 | 2 | 1 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 | 9 |
1 | 3 | 2 | 2 | 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 | 8 |
2 | 4 | 3 | 3 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 5 | 6 | 7 |
3 | 5 | 4 | 4 | 3 | 3 | 2 | 3 | 4 | 5 | 5 | 6 |
4 | 6 | 5 | 4 | 4 | 4 | 3 | 3 | 4 | 4 | 5 | 6 |
7 | 7 | 6 | 5 | 5 | 5 | 4 | 4 | 3 | 4 | 5 | 6 |
8 | 8 | 7 | 6 | 6 | 6 | 5 | 5 | 4 | 4 | 5 | 6 |
1 | 9 | 8 | 7 | 6 | 6 | 6 | 6 | 5 | 5 | 5 | 5 |
可知,LD(A,B)=5,最佳匹配为
A:4812347_81
B:4411327431
再按照LCS算法,计算LCS矩阵
4 | 4 | 1 | 1 | 3 | 2 | 7 | 4 | 3 | 1 | ||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |
4 | 0 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
8 | 0 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
1 | 0 | 1 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 |
2 | 0 | 1 | 1 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 |
3 | 0 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 |
4 | 0 | 1 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 |
7 | 0 | 1 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 |
8 | 0 | 1 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 |
1 | 0 | 1 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 5 |
可知,LCS(A,B)=5,匹配为
A:4_81_234781
B:44113274_31
不是最佳匹配,而蓝色部分41241的确是最长公共子序列。只是和LD算法算出的最长公共子序列不一样而已。这个说明,最长公共子序列不是唯一的。问题出在哪?出在白色部分的第7行第8列这个单元格的回溯上,在这个单元格,有两个方向可以选,一个是向上,一个是向左,在前文中说到,回溯时优先考虑左上角、上方、下方的顺序。这个是不完全正确的。本例中,这个单元格向左回溯能得到最佳匹配。
然后看看,Nakatsu算法的L矩阵
4 | 8 | 1 | 2 | 3 | 4 | 7 | 8 | 1 | ||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
i=0 | i=1 | i=2 | i=3 | i=4 | i=5 | i=6 | i=7 | i=8 | i=9 | |
k=0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
k=1 | V | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
k=2 | V | V | V | 3 | 3 | 3 | 2 | 2 | 2 | 2 |
k=3 | V | V | V | V | 6 | 5 | 5 | 5 | 5 | 3 |
k=4 | V | V | V | V | V | 9 | 8 | 7 | 7 | 7 |
k=5 | V | V | V | V | V | V | V | V | V | 10 |
k=6 | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V |
k=7 | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V |
k=8 | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V |
k=9 | V | V | V | V | V | V | V | V | V | V |
正如网友Sumtec指正,红色部分才是最长公共子序列的下标。
出于好奇,我分析了L矩阵中那些数值
L(k,i)=j→LCS(i,j)=k
于是在LCS中,把这些对应值表示出来
4 | 4 | 1 | 1 | 3 | 2 | 7 | 4 | 3 | 1 | ||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | |
4 | 0 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
8 | 0 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 |
1 | 0 | 1 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 | 2 |
2 | 0 | 1 | 1 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 3 |
3 | 0 | 1 | 1 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 |
4 | 0 | 1 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 |
7 | 0 | 1 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 |
8 | 0 | 1 | 2 | 2 | 2 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 4 |
1 | 0 | 1 | 2 | 3 | 3 | 3 | 3 | 4 | 4 | 4 | 5 |
可以看出,L矩阵的元素表示每一行每个值出现的最左边的位置。这个能求出最长公共子序列。不过,能否求出最佳匹配,还得思量一番。
最近在研究国外的两篇论文,估计研究完了,应该会有所收获。
《A longest common subsequence algorithm suitable for similar text strings》
《An almost-linear time and linear space algorithm for the longest common subsequence problem》
在这里打个广告。这两篇论文,在网上能找到下载页面,但因为没有帐号,所以一直无法下载。昨天在“小米粒资源网”上发帖求助,不过半小时而已,就有人帮你下载,共享给你。效果非常好,在这里也向帮我下载的网友致敬。如果,你需要找一些学术论文(无论是中文的还是英文的),不妨在“小米粒资源网”试试,也许会有意想不到的惊喜。
本文转自万仓一黍博客园博客,原文链接:http://www.cnblogs.com/grenet/archive/2011/02/22/1961092.html,如需转载请自行联系原作者