metaxcan出现“AttributeError: Can only use .str accessor with string values!”报错的解决方案

metaxcan时遇到报错提示:AttributeError: Can only use .str accessor with string values!
metaxcan出现“AttributeError: Can only use .str accessor with string values!”报错的解决方案

仔细排查,发现是输入文件分隔符的问题。
我的输入文件分隔符是空白分隔符,而metaxcan要求输入文件分隔符必须是tab

因此,重新生成输出分隔符为tab的文件:
awk -v OFS=‘\t‘ ‘{print $1,$2,$3,$4}‘ input > newinput

再次运行metaxcan就没报错了。
metaxcan出现“AttributeError: Can only use .str accessor with string values!”报错的解决方案

metaxcan出现“AttributeError: Can only use .str accessor with string values!”报错的解决方案

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