跑metaxcan
时遇到报错提示:AttributeError: Can only use .str accessor with string values!
仔细排查,发现是输入文件分隔符的问题。
我的输入文件分隔符是空白分隔符
,而metaxcan
要求输入文件分隔符必须是tab
因此,重新生成输出分隔符为tab
的文件:awk -v OFS=‘\t‘ ‘{print $1,$2,$3,$4}‘ input > newinput
再次运行metaxcan
就没报错了。
metaxcan出现“AttributeError: Can only use .str accessor with string values!”报错的解决方案