EM 算法 实例

#coding:utf-8
import math
import copy
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt isdebug = True #指定k个高斯分布參数,这里指定k=2。 #注意2个高斯分布具有同样方差Sigma。均值分别为Mu1,Mu2。
#共1000个数据 #生成训练样本。输入6,40,20,2
#两类样本方差为6。
#一类均值为20。一类为40
#随机生成1000个数
def ini_data(Sigma,Mu1,Mu2,k,N):
#保存生成的随机样本
global X #求类别的均值
global Mu
#保存样本属于某类的概率
global Expectations #1*N的矩阵。生成N个样本
X = np.zeros((1,N))
#随意给定两个初始值,任猜两类均值
#赋值一次就可以,最后要输出的量
Mu = np.random.random(2) #0-1之间
print Mu
#给定1000*2的矩阵。保存样本属于某类的概率
Expectations = np.zeros((N,k)) #生成N个样本数据
for i in xrange(0,N):
#在大于0.5在第1个分布,小于0.5在第2个分布
if np.random.random(1) > 0.5:
#均值40加上方差倍数。样本数据满足N(40,Sigma)正态分布
X[0,i] = np.random.normal()*Sigma + Mu1 #
else:
#均值40加上方差倍数,样本数据满足N(20,Sigma)正态分布
X[0,i] = np.random.normal()*Sigma + Mu2 if isdebug:
print "***********"
print u"初始观測数据X:"
print X #E步 计算每一个样本属于男女各自的概率
#输入:方差Sigma。类别k。样本数N
def e_step(Sigma,k,N):
#样本属于某类概率
global Expectations
#两类均值
global Mu
#样本
global X #遍历全部样本点,计算属于每一个类别的概率
for i in xrange(0,N):
#分母,用于归一化
Denom = 0
#遍历男女两类,计算各自归一化分母
for j in xrange(0,k):
#计算分母
Denom += math.exp((-1/(2*(float(Sigma**2))))*(float(X[0,i]-Mu[j]))**2) #遍历男女两类,计算各自分子部分
for j in xrange(0,k):
#分子
Numer = math.exp((-1/(2*(float(Sigma**2))))*(float(X[0,i]-Mu[j]))**2)
#每一个样本属于该类别的概率
Expectations[i,j] = Numer/Denom if isdebug:
print "***********"
print u"隐藏变量E(Z):"
print len(Expectations)
#数据总个数
print Expectations.size
#矩阵数据
print Expectations.shape
#打印出隐藏变量的值
print Expectations #M步 期望最大化
def m_step(k,N):
#样本属于某类概率P(k|xi)
global Expectations
#样本
global X
#计算两类的均值
#遍历两类
for j in xrange(0,k):
Numer = 0
Denom = 0
#当前类别下,遍历全部样本
#计算该类别下的均值和方差
for i in xrange(0,N):
#该类别样本分布P(k|xi)xi
Numer += Expectations[i,j]*X[0,i]
#该类别类样本总数Nk,Nk等于P(k|xi)求和
Denom +=Expectations[i,j]
#计算每一个类别各自均值uk
Mu[j] = Numer / Denom #算法迭代iter_num次。或达到精度Epsilon停止迭代
#迭代次数1000次, 误差达到0.0001终止
#输入:两类同样方差Sigma。一类均值Mu1,一类均值Mu2
#类别数k。样本数N,迭代次数iter_num。可接受精度Epsilon
def run(Sigma,Mu1,Mu2,k,N,iter_num,Epsilon):
#生成训练样本
ini_data(Sigma,Mu1,Mu2,k,N)
print u"初始<u1,u2>:", Mu #迭代1000次
for i in range(iter_num):
#保存上次两类均值
Old_Mu = copy.deepcopy(Mu)
#E步
e_step(Sigma,k,N)
#M步
m_step(k,N) #输出当前迭代次数及当前预计的值
print i,Mu #推断误差
if sum(abs(Mu-Old_Mu)) < Epsilon:
break if __name__ == '__main__': #sigma,mu1,mu2,模型数,样本总数,迭代次数,迭代终止收敛精度
run(6,40,20,2,1000,1000,0.0001)
plt.hist(X[0,:],100) #柱状图的宽度
plt.show()
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