使用pybind11为Python编写C++扩展（一）配置篇：Build（编译和链接）

2021-10-02 00:46:16

Setuptools
CMake

最后决定选用pybind11，理由如下：

比python原生的C API看起来人性多了
我的C++代码不是现成的，需要一定的C++开发工作量，所以感觉cython不是很方便。如果C++接口已经给好了，只需要简单包装一下，Cython可能更好。
pybind11声称只包含头文件，且能通过pip安装，感觉比boost_python轻量且最后这个扩展包容易分发。此外，感觉它的文档也比boost python友好不少……

Setuptools

参考官方的Setuptools构建文档

这种方式适合python包的构建、打包、分发、上传到PyPi一条龙服务。python使用C++扩展需要在setup.py里配置好Extension。以下是一个setup.py的样例：

import glob
import os.path
from distutils.core import setup

__version__ = "0.0.1"

# make sure the working directory is BASE_DIR
BASE_DIR = os.path.dirname(__file__)
os.chdir(BASE_DIR)

ext_modules = []

try:
    from pybind11.setup_helpers import Pybind11Extension, ParallelCompile, naive_recompile

    # `N` is to set the bumer of threads
    # `naive_recompile` makes it recompile only if the source file changes. It does not check header files!
    ParallelCompile("NPY_NUM_BUILD_JOBS", needs_recompile=naive_recompile, default=4).install()

    # could only be relative paths, otherwise the `build` command would fail if you use a MANIFEST.in to distribute your package
    # only source files (.cpp, .c, .cc) are needed
    source_files = glob.glob('source/path/*.cpp', recursive=True)

    # If any libraries are used, e.g. libabc.so
    include_dirs = ["INCLUDE_DIR"]
    library_dirs = ["LINK_DIR"]
    # (optional) if the library is not in the dir like `/usr/lib/`
    # either to add its dir to `runtime_library_dirs` or to the env variable "LD_LIBRARY_PATH"
    # MUST be absolute path
    runtime_library_dirs = [os.path.abspath("LINK_DIR")]
    libraries = ["abc"]

    ext_modules = [
        Pybind11Extension(
            "package.this_package", # depends on the structure of your package
            source_files,
            # Example: passing in the version to the compiled code
            define_macros=[('VERSION_INFO', __version__)],
            include_dirs=include_dirs,
            library_dirs=library_dirs,
            runtime_library_dirs=runtime_library_dirs,
            libraries=libraries,
            cxx_std=14,
            language='c++'
        ),
    ]
except ImportError:
    pass

setup(
    name='project_name',  # used by `pip install`
    version='0.0.1',
    description='xxx',
    ext_modules=ext_modules,
    packages=['package'], # the directory would be installed to site-packages
    setup_requires=["pybind11"],
    install_requires=["pybind11"],
    python_requires='>=3.8',
    include_package_data=True,
    zip_safe=False,
)

一些需要注意的点（坑）：

如果需要通过sdist（即.tar.gz的源码方式）发布包的话，Extension的source_files字段必须是相对路径。否则build的时候会因为egg-info里的SOURCE.txt里有绝对路径而报错。但由此带来的问题是我们不能确定跑setup.py的时候工作目录是啥，为了保险起见，需要把它设置成setup.py所在的目录。
在安装包之前，为了获取一些metadata，setuptools会先跑一次setup.py，这个时候如果没有装pybind11，会报错。为了解决这个问题：
- 为了能正常执行到setup函数，我们需要先保证没有pybind11的情况下执行这个文件也不会报错。所以我们需要把所有依赖pybind11.setup_helpers的部分都放到try里。
  
  也有其它的方法，比如直接复制一个setup_helpers啥的，具体可以看文档。
- 根据setuptools的文档，setup_requires并不会安装包，所以pybind11也需要加到install_requires里。
- 最后，在安装本包前，setuptools会先安装依赖项，然后再跑setup.py install，这时就可以成功build和安装了。
如果你的外接库不在系统查找动态库的指定路径里，那么指定link_dirs之后，编译和链接不会出错。但执行的时候还是会因为找不到动态库而报错。可以通过添加runtime_library_dirs（等价于-Wl,-rpath），或者给LD_LIBRARY_PATH环境变量里添加这个路径。
编译后的.so的位置，以及你的C++ module在python里的名字，取决于你给Extension写的名字。例如，你希望文件结构是这样：
```
project_dir
    |-- package
    |   |-- __init__.py
    |   |-- this_package.xxxx.so
    |   |-- other.py
    |-- setup.py
```
这样你最后在site-packages里只会新建一个包叫package。

此外，哪怕你这个project只想导出一个.so里的模块，把它放到一个文件夹里包装起来也会更好。因为如果你只想导出一个this_package，把setup函数里的配置改成了packages=['this_package']，这个.so文件会直接被加到site-packages，感觉不是很优雅。

这时候你的Extension的名字就需要是package.this_package。这样.so的位置就是对的，你运行import package.this_package就会正确地找到.so并执行了。
但是，要保证执行.so不出错，在C++里通过PYBIND11_MODULE把这个扩展expose到python里的时候，名字也要对应：
```
PYBIND11_MODULE(this_package, m) {}
```

CMake

参考官方的CMake构建文档。

如果是编译嵌入python的C++程序，可以用CMake，比较方便。

虽然python extension似乎也可以用CMake，但是还是setuptools比较方便。

我这里主要是用CMake编译C++部分的测试。CMakeLists.txt大概长这样：

# the CMakeList to test the C++ part from a C entry point
cmake_minimum_required(VERSION 3.21)
project(project_name)

set(CMAKE_CXX_STANDARD 14)

# Find pybind11
find_package(pybind11 REQUIRED)

# If any library (e.g. libabc.so) is needed
include_directories(INCLUDE_DIR)
link_directories(LINK_DIR)

# Add source file
file(GLOB A_NAME_FOR_SOURCE CONFIGURE_DEPENDS "source/path/*.cpp")
file(GLOB A_NAME_FOR_TEST CONFIGURE_DEPENDS "test/path/*.cpp")
add_executable(TARGET_NAME test_cpp_part.cpp ${A_NAME_FOR_SOURCE} ${A_NAME_FOR_TEST})
target_link_libraries(TARGET_NAME abc pybind11::embed)

project_name随便写
TARGET_NAME随便写，只要add_executable和target_link_libraries对应就行，是最后的可执行文件的名字
A_NAME_FOR_SOURCE和A_NAME_FOR_TEST是一个CMake的中间变量名，随便写，它们分别代表了GLOB找到的一堆源文件，和用于测试的一堆文件
INCLUDE_DIR里是库abc的头文件，LINK_DIR里必须包含库文件，动态库类似libabc.so，静态库类似libabc.a。
Link到pybind11::embed的原因是防止带python对象的那部分C++代码编译失败。

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Setuptools

CMake

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