思路：定义全局的array（selectedIds），当列表选中的时候就push进去，当列表取消选中时，将该项从selectedIds中删除

重点：1.列表加载完成时为列表增加复选框，并给每一个checkbox赋name；

           2.回显时模拟checkbox的click事件；

代码如下：

var selectedIds = [];
$(function () {
    InitChooseCourseList();
    //绑定搜索
    $("#SearchCourseForChoose").click(function () {
        SearchForChoose();
    });
});

//页面列表初始化
function InitChooseCourseList() {
    var $gridList = $("#gridList");
    var postData = $('#CourseForm').formSerialize();
    var classId = $("#ClassId").val();
    postData["ClassId"] = classId;
    $gridList.Grid({
        mtype: 'Post',
        postData: postData,
        url: "/TopOnline/Class/ChooseCourseGrid",
        height: ($(window).height() - 145),
        colModel: [
            { label: 'ID', name: 'ID', hidden: true },
            { label: 'CourseSubjectId', name: 'CourseSubjectId', hidden: true },
            { label: '课程名称', name: 'Name', width: fixJqgridColumnWidthByPercent(0.45), align: 'center' },
            { label: '所属科目', name: 'CourseSubjectName', width: fixJqgridColumnWidthByPercent(0.45), align: 'center' }
        ],
        pager: '#gridPager',
        viewrecords: true,
        multiselect: true,
        //为表格增加复选框
        gridComplete: function () {
            var rowIds = jQuery("#gridList").jqGrid('getDataIDs');
            for (var k = 0; k < rowIds.length; k++) {
                var curRowData = jQuery("#gridList").jqGrid('getRowData', rowIds[k]);
                var curChk = $("#" + rowIds[k] + "").find(":checkbox");
                curChk.attr('name', 'check_box_' + curRowData['ID']);   //给每一个checkbox赋名字
                curChk.attr('value', curRowData['ID']);   //给checkbox赋值
                curChk.attr('style', 'margin:7px;');
            }
        },
        //加载完成模拟复选框的点击事件
        loadComplete: function (xhr) {
            var rowArray = xhr.rows;
            if (selectedIds.length > 0) {
                var count = 0;
                $.each(rowArray, function (i, item) {
                    if (selectedIds.indexOf(item.ID.toString()) > -1) {
                        //判断arrayNewList中存在item.Id值时，选中前面的复选框，
                        $("[name='check_box_" + item.ID + "']").trigger('click');
                        count++;
                    }
                });
                if (rowArray.length == count) {
                    $("#cb_gridList").prop("checked", true);
                }
            }
        },
        //全选触发事件
        onSelectAll: function (aRowids, status) {
            var rowData = $(this).jqGridRowValue();//操作行
            var pageRowData = $(this).getRowData();//当前列表所有行
            if (status == true) {
                //循环aRowids数组，将Id放入selectedIds数组中
                saveData(rowData);
            } else {
                deleteIndexData(rowData, pageRowData);
            }
        },
        //选中某行触发事件
        onSelectRow: function (aRowids, status) {
            var rowData = $(this).jqGridRowValue();//操作行
            var pageRowData = $(this).getRowData();//当前列表所有行
            if (status == true) {
                if (rowData.length == $(this)[0].rows.length - 1) {
                    $("#cb_gridList").prop("checked", true);
                }
                saveData(rowData);
            } else {
                deleteIndexData(rowData, pageRowData);
            }
        }
    });
};

//将Id放入selectedIds数组中
function saveData(obj) {
    $.each(obj,
        function (i, item) {
            if (selectedIds.indexOf(item.ID) < 0)
                selectedIds.push(item.ID);
        });
}

//将Id从selectedIds中删除 （仅删除当前页面列表中的数据）
function deleteIndexData(obj,pageObj) {
    var rowDataIds = [];
    var pageRowDataIds = [];
    $.each(obj,
        function (i, item) {
            rowDataIds.push(item.ID);
        });
    $.each(pageObj,
        function (i, item) {
            pageRowDataIds.push(item.ID);
        });
    $.each(selectedIds,
        function (i, sItem) {
            if (pageRowDataIds.indexOf(sItem)>0 && rowDataIds.indexOf(sItem) < 0) {
                selectedIds.splice(i, 1);
                i--;
            }
        });
}

辅助代码：

$.fn.jqGridRowValue = function () {
    var $grid = $(this);
    var selectedRowIds = $grid.jqGrid("getGridParam", "selarrrow");
    var json = [];
    var rowData;
    if (selectedRowIds != "") {
        var len = selectedRowIds.length;
        for (var i = 0; i < len; i++) {
            rowData = $grid.jqGrid('getRowData', selectedRowIds[i]);
            json.push(rowData);
        }
    } else {
        if (!!$grid.jqGrid('getGridParam', 'selrow')) {
            rowData = $grid.jqGrid('getRowData', $grid.jqGrid('getGridParam', 'selrow'));
            json.push(rowData);
        }
    };
    return json;
}