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R语言H2o包的几个应用案例
笔者寄语:受启发想了解H2o平台的一些R语言实现,网上已有一篇H2o的demo文件。笔者在这多贴一些案例,并且把自己实践的一些小例子贴出来。
关于H2o平台长啥样,可以看H2o的官网,关于深度学习长啥样,可以看一些教程,比如ParallelR博客之中的解析。
下面主要是贴几个案例,让大家看看。
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Matt︱R语言调用深度学习架构系列引文
R用户的福音︱TensorFlow:TensorFlow的R接口
本文中介绍的H2o包在调用的过程主要有以下简要步骤:
连接、搭建H2o环境(heo.init())——数据转换成h2o格式(as.h2o)——模型拟合(h2o.deeplearning)——预测(h2o.predict)——数据呈现(h2o.performance)。
一、H2o包的demo(glm)
网上已经有了,博客笔者看了并做了简单的中文注释。详情可以见std1984博客。
二、来自ParallelR博客的案例
博客中主要是为了说明深度学习要比其他普通学习方法的精度高。数据是H2o网站数据,笔者windows系统下没有能够下载到该数据,所以后续的分析都没有办法继续进行了。
library(h2o) # single thread h2o.init() #连接h2o平台 train_file <- "https://h2o-public-test-data.s3.amazonaws.com/bigdata/laptop/mnist/train.csv.gz" test_file <- "https://h2o-public-test-data.s3.amazonaws.com/bigdata/laptop/mnist/test.csv.gz" train <- h2o.importFile(train_file) test <- h2o.importFile(test_file) # To see a brief summary of the data, run the following command summary(train) summary(test) y <- "C785" x <- setdiff(names(train), y) # We encode the response column as categorical for multinomial #classification train[,y] <- as.factor(train[,y]) test[,y] <- as.factor(test[,y]) # Train a Deep Learning model and valid system.time( model_cv <- h2o.deeplearning(x = x, y = y, training_frame = train, distribution = "multinomial", activation = "Rectifier", hidden = c(32), l1 = 1e-5, epochs = 200) )
三、最简单的案例——基于iris数据集的深度学习
本案例主要来自h2o官方手册中,h2o.deeplearning包的示例,比较简单易懂。如果你想看预测的数据可以用as.data.frame来变成R能识别的数据框格式。
##参考来自:h2o官方手册,h2o.deeplearning函数的示例 library(h2o) h2o.init() iris.hex <- as.h2o(iris) iris.dl <- h2o.deeplearning(x = 1:4, y = 6, training_frame = iris.hex) #模型拟合 # now make a prediction predictions <- h2o.predict(iris.dl, iris.hex) #预测 as.data.frame(predictions) #预测数据变成数据框 performance = h2o.performance(model = iris.dl) print(performance)
输出的结果长成下面这个样子。
大概构成是:模型评价指标+混淆矩阵+一些指标的阈值(这个是啥??)
看到混淆矩阵,你就差不多懂了~
> print(performance) H2OBinomialMetrics: deeplearning ** Reported on training data. ** Description: Metrics reported on full training frame MSE: 0.01030833 R^2: 0.9536125 LogLoss: 0.05097025 AUC: 1 Gini: 1 Confusion Matrix for F1-optimal threshold: 0 1 Error Rate 0 100 0 0.000000 =0/100 1 0 50 0.000000 =0/50 Totals 100 50 0.000000 =0/150 Maximum Metrics: Maximum metrics at their respective thresholds metric threshold value idx 1 max f1 0.983179 1.000000 49 2 max f2 0.983179 1.000000 49 3 max f0point5 0.983179 1.000000 49 4 max accuracy 0.983179 1.000000 49 5 max precision 0.999915 1.000000 0 6 max recall 0.983179 1.000000 49 7 max specificity 0.999915 1.000000 0 8 max absolute_MCC 0.983179 1.000000 49 9 max min_per_class_accuracy 0.983179 1.000000 49 Gains/Lift Table: Extract with `h2o.gainsLift(<model>, <data>)` or `h2o.gainsLift(<model>, valid=<T/F>, xval=<T/F>)`
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