含有染色体长的文件chr_len.txt
chr1 10
chr2 20
chr3 30
chr4 40
chr5 50
python脚本
#传递命令行参数
import sys # 导入模块
# 从命令行获取文件名称
f_chr_len = sys.argv[1] # 定义命令行参数，1表示变量1
# 打开文件 open('文件路径')
f = open(f_chr_len)
# 逐行读取
total_len = 0
lines = f.readlines() # 是一个列表
for line in lines:
line = line.strip () # 字符串.strip()意思是去掉末尾的\n换行符
print(line)
chr_len = line.split(' ') # splint是按照特定的字符对字符串进行分割，返回值为数组
print(chr_len)
total_len += int(chr_len[1])
# 输出结果
print(total_len)
命令行输入
python fasta_stat5.py chr_len.txt