python .dcm文件读取,并转化为.jpg格式

.dcm文件是DICOM(Digital Imaging and Communications in Medicine)即医学数字成像和通信中记录医学图像和相关信息的文件,在用于医学图像处理的时候我们需要将·.dcm文件中的图像信息读取到python程序中来,下面展示了一个简单的示例。

安装pydicom
在python环境下安装pydicom只需要在命令行窗口中输入:

pip install pydicom

 实例如下:

import pydicom
import matplotlib.pyplot as plt
import scipy.misc

in_path = './00C1E256-E3F7-431D-BCB6-DD1EF09E7DFE/fd0beb35-2d21-4bb8-a9d8-91effa9b5e6d_00001.dcm'
out_path = './output.jpg'
ds = pydicom.read_file(in_path)  #读取.dcm文件
img = ds.pixel_array  # 提取图像信息
print(img.shape)
plt.imshow(img)
plt.show()
scipy.misc.imsave(out_path,img)  # 

  

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