ITK-SNAP打开Synapse数据集

1、参考:02-ITKSNAP基本使用-知识-名师课堂-爱奇艺

test后得到预测结果:测试集每个样本对应三个nifti格式(3D)的图像文件,原图像、分割真实值ground truth和预测的分割结果

ITK-SNAP打开Synapse数据集

使用ITK-SNAP软件打开原图像文件,可通过file->main image,选择进来;也可直接拖拽进来,并选择main image。

选择img图像后,再将gt图像(里面有label值,对应不同颜色)添加进来作为分割图像。另外再打开一个软件窗口,将img图像选择作为additional main image,再将pred图像(里面有label值,对应不同颜色)添加进来作为additional segmentation image。

两个窗口自动同步进行,对比看即可。

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 下图是打开图像有一个失真提示。

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 其中,zoon to fit,都点击后恢复原本样子;点击小窗口右上方框A能全屏,点击照相机标志可以截屏此处的帧;滚动滚轮,帧数切换;右键拖拽放大或缩小图像;右下角显示70 of 139指有139维,现在是第70张,点击左边那个图层图标的info可查看维度信息;点击左边的调色盘图标可查看label值及相应颜色RGB信息,此处自己可以按照需要更改,可通过FastStone Capture等软件的取色器取色并设置。

ITK-SNAP打开Synapse数据集

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2、取几帧gt和pred对比图放到visio里面组合,做成数据集图。

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