[Python]基于K-Nearest Neighbors[K-NN]算法的鸢尾花分类问题解决方案

  看了原理,总觉得需要用具体问题实现一下机器学习算法的模型,才算学习深刻。而写此博文的目的是,网上关于K-NN解决此问题的博文很多,但大都是调用Python高级库实现,尤其不利于初级学习者本人对模型的理解和工程实践能力的提升,也不利于Python初学者实现该模型。

  本博文的特点:

    一 全面性地总结K-NN模型的特征、用途

    二  基于Python的内置模块,不调用任何第三方库实现

  博文主要分为四部分:

    基本模型(便于理清概念、回顾模型)

    对待解决问题的重述

    模型(算法)和评价(一来,以便了解模型特点,为以后举一反三地应用作铺垫;二来,有利于以后快速复习)、

    编程实现(Code)。

  特别声明:

    1.劳动成果开源,未经同意博主(千千寰宇:http://cnblogs.com/johnnyzen),不得以任何形式转载、复制。

    2.如有纰漏或者其他看法,欢迎共同探讨~

零 基本模型

  (本部分内容,均来源于引用[1],其原理讲解十分通俗易懂)

  ①K-近邻算法,即K-Nearest Neighbor algorithm,简称K-NN算法。单从名字来猜想,可以简单粗暴的认为是:K个最近的邻居,当K=1时,算法便成了最近邻算法,即寻找最近的那个邻居。

  ②所谓K-NN算法,即是给定一个训练数据集,对新的输入实例,在训练数据集中找到与该实例最邻近的K个实例(也就是K个邻居), 这K个实例的多数属于某个类,就把该输入实例分类到这个类中。

  ③实例

    猜猜看:有一个未知形状(绿色圆点),如何判断其是什么形状?

    问题:给这个绿色的圆分类?

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    对噪声数据过于敏感。为了解决这个问题,我们可以把位置样本周边的多个最近样本计算在内,扩大参与决策的样本量,以避免个别数据直接决定决策结果。

    有两类不同的样本数据,分别用蓝色的小正方形和红色的小三角形表示,而图正中间的那个绿色的圆所标示的数据则是待分类的数据。

    如果K=3,判定绿色的这个待分类点属于红色的三角形一类。

    如果K=5,判定绿色的这个待分类点属于蓝色的正方形一类。

一 问题

  题目:ML之k-NN:k-NN实现对150朵共三种花的实例的萼片长度、宽,花瓣长、宽数据统计,根据一朵新花的四个特征来预测其种类
  数据源:https://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning-databases/iris/iris.data
  数据源说明:https://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning-databases/iris/iris.names

[Python]基于K-Nearest Neighbors[K-NN]算法的鸢尾花分类问题解决方案

二 解决过程及模型评价

  一 审题/准备数据集
    1.1 明确问题基本模型,及涉及要素(特征值、有无标记、可考虑的基本算法模型):K-NN、分类、监督学习、有标记、鸢尾花分类
    1.2 准备数据集及其处理方法
      数据源:https://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning-databases/iris/iris.data
      数据源说明:https://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning-databases/iris/iris.names
  二 分析并设计解决思路(算法步骤)
    2.0 零 样本及样本空间、测试空间的程序表示
        设计样本的class类:Iris(鸢尾花类):
          便于将样本空间以数组化表示 + 便于后期训练对各样本的取值、标记、比对等操作
    2.1 一 读取数据集,装载样本集
        提取文件数据至计算机进程(程序)中,并恰当地表示样本、样本集、测试集
      文件I/O操作:
        open(filepath+filename,mode)、
        file.readline()、
        file.readlines()、
        file.next()、
      字符串处理:
        str.split():切割
        float(str)、int(str):数值转换
      注意:对数据集文件中无关数据的处理(跳行、文件转进制、跳列等过滤)
    2.2 二 训练测试样本
      算法描述:[以鸢尾花分类为例]
        遍历测试样本
          计算测试样本与已标记的样本的欧式距离
        对各欧式距离升序排序
        选择前K项的已样本作为一子集( 即 选择最近的K项邻居作为参照标准)
          遍历统计,已标记子集的花朵种类何种花朵数目种类最多
        设置当前测试样本的预测花朵种类为该种
        结束。
      注释:花的种类分别为:Iris-setosa、Iris-versicolor、Iris-virginica;共计3种。
    2.3 三 计算预测准确率
      rate = Count(测试验证集中,已标记值 == 预测值 的样本) / 测试验证集总数
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    2.4 四 模型检验(未做)
  三 编程实现

    (见第三部分示范代码)

  四 总结模型[K-NN]
    针对本问题
      0 样本数据集的样本顺序排列,选拔初始的参照样本空间时,需要先将数据集乱序排序,再做选拔;否则,分类准确率往往趋于0
        原因:对未纳入训练样本对应种类的待测样本,几乎无真实参照集合,所以将导致预测结果差得离谱(准确率趋于0)。
    涉及因素
      0 特征向量Features
        影响算法的处理效率:特征向量数越多,计算量越大,处理时间越长。
        影响算法的结果正确性:K值越多,可参照指标越多,结果越趋于正确。
      1 K:K个最近邻居元素的控制
        控制待预测样本的参照边界
        影响算法的结果正确性:
        K=1时,选拔最近的元素的标记值作为预测值
      2 Weight权值:对参照邻居的选拔标准
        标准:欧式距离、切比雪夫距离、马氏距离(这个,目前不清楚)、最近者赋予更大权值(增加其重要性)
        控制参照样本对待测样本的重要性
        有利于选拔最贴近真实预测结果、最符合的样本
      3 已预测并标记的样本是否加入参照样本集,影响后续待测样本预测?
      4 样本数量与种类
        标准:种类全面、数量按比例丰富;在上前提下,样本越多越好
          否则,尤其是种类覆盖不全面时,可能严重影响对偏未标记种类的样本预测效果
        样本种类↑,数量↑,预测准确率↑,预测处理效率↓
    总结性评价
      1 监督学习、分类问题
      2 基于实例数据的非参数学习算法
        Input:已标记数据集中的K个最近的训练样本组成
        Output:判别待测样本之类型
      3 可用于非线性分类
      4 样本种类↑,数量↑,特征向量↑:预测准确率↑,预测处理效率↓
      5 性能与完美的准确性不能绝对两全
        总体处理的复杂度:O(n)
      6 对异常值不敏感
      7 总体来说,准确度高,无人为因素。
      8 K值大小对结果的准确性要视具体情况而定,人为调参优化
      9 样本数量与种类:
        标准:种类全面、数量按比例丰富;在上前提下,样本越多越好
        否则,尤其是种类覆盖不全面时,可能严重影响对偏未标记种类的样本预测效果
      10   已预测的样本是否加入参照样本空间,将影响后续待测样本对预测结果起多大作用是一个可考虑的问题
      11 其他:
        需要提前知道样本空间之所有种类
        预测样本时,计算量大,[不利于实时预测],偏胖服务器模式
      12 模型常见实践:
        手写数字识别系统
        鸢尾花分类
        爱情片与动作片分类
        约会网站匹配
        对新贷款用户的还款情况预测
        ========================
        文本分类
三 编程实现(For Python)
  工程文件分为三部分:
    __init__.py【main()启动函数、核心算法】
    Iris.py【设计数据结构(类)、模块(职责分离)】
    file_handle.py【数据提取、文件处理】
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    由于前面第二部分已经详细叙述,且代码中注释已经十分详细,便不在对代码进行解释,阅读注释便容易懂。

    __init__.py

import random;
import math;
import Iris; # 自定义
import file_handle; # 自定义 #if __name__ == '__main__': #__name__ == '__main__'是Python的main函数入口
def main(print_test=False,print_samples=False):
follows = []; # 样本集空间(前sampleAmount项)+测试集空间(后 sampleAll-sampleAmount项)
data = ""; # 样本数据(前sampleAmount项)+测试集空间(后 sampleAll-sampleAmount项)
sampleAll = 150;
sampleAmount = 100; # 标记样本集数目(剩余的便作为测试集)
k = 5;
test_print = print_test; ########## 一 读取数据集,装载样本集
##### 1.1 加载数据集数据
data = file_handle.read("./dataset/data.txt",1,'r');#1:忽略第一行
# print(data);
list = data.split('\n');
i = 0;
for line in list: # 如:line = "5.1,3.5,1.4,0.2,Iris-setosa"
item = line.split(',');# 如:item = [5.1,3.5,1.4,0.2,Iris-setosa]
label_species = item.pop();#移除最后一项:标记种类
#print("[test] item:", item,"\tlabel_species:", label_species); # test
follows.append(Iris.Iris(item,label_species));
#print("[ ",i," ] ",follows[i].toString());
i += 1;
pass;
random.shuffle(follows); # 【千万注意!!!】由于原数据集是有序的,如果不做乱序处理,预测结果会及其不理想(准确率,趋近于0),当然,这也是这一模型的缺陷之一
##### 1.2 选择前100项 作为已标记样本集
#i = 0;
#for i in range(sampleAmount):
# follows[i].setPredictSpecies(follows[i].label_species);
# pass; ########## 二 训练测试样本
##### 2.1 对101 - 150 项的测试集进行训练/预测
## 算法描述:
## 遍历测试样本
## 计算测试样本与已标记的样本的欧式距离
## 对各欧式距离升序排序
## 选择前K项的已样本作为一子集( 即 选择最近的K项邻居作为参照标准)
## 遍历统计,已标记子集的花朵种类何种花朵数目种类最多
## 设置当前测试样本的预测花朵种类为该种
## 结束。
## 注释:花的种类分别为:Iris-setosa、Iris-versicolor、Iris-virginica;共计3种。
offset = 0; # 测试空间偏移量:目的是为了将通过偏移量,增大原已标记样本空间的样本数量 即 使已预测的测试样本加入参照样本空间。
for x in range(sampleAmount,sampleAll):# x:测试样本下标
weights = [];# 对各欧式距离(权值)的升序排序列表
for y in range(0,sampleAmount+offset):
result = (math.sqrt( + \
math.pow(follows[y].features[0] - follows[x].features[0],2) + \
math.pow(follows[y].features[1] - follows[x].features[1],2) + \
math.pow(follows[y].features[2] - follows[x].features[2],2) + \
math.pow(follows[y].features[3] - follows[x].features[3],2)), y);# 存储x,方便排序后定位花朵
#print("[test] weights[x]:", result);
weights.append(result);
pass;
weights.sort(key = lambda item:item[0]); # 以各元组内第一首项[欧氏距离]为键,默认升序排序
if test_print:
for m in range(len(weights)): # 输出预测权重
print("[test] weights[",m,"]:",weights[m],"\tweights[",m,"][1] > ",weights[m][1],":",follows[weights[m][1]].toString());
kinds_count = {"Iris-setosa":0,"Iris-versicolor":0,"Iris-virginica":0}; # 对已标记样本空间中各种花的数目统计作初始化
for z in range(0,k): # 选择前K项的已样本作为一子集( 即 选择最近的K项邻居作为参照标准)
if test_print:
print("[test] 排名前",z+1,"项 follows[",z,"]:",follows[weights[z][1]].toString());
label_species = follows[weights[z][1]].label_species;
if(label_species == 'Iris-setosa'):
kinds_count["Iris-setosa"] += 1;
elif label_species == 'Iris-versicolor':
kinds_count["Iris-versicolor"] += 1;
elif label_species == 'Iris-virginica':
kinds_count['Iris-virginica'] += 1;
else:
print("[ERROR:Unknown Species] follows[",weight[z][1],"]:",follows[weight[z][1]]);
pass;
result = max(kinds_count.items(), key = lambda item:item[1]); # 取统计花类数字典中最大值对应的序列
follows[x].predict_species = result[0]; # 标记预测种类
if test_print:
print("[test] 预测结果",result, " [follows[",x,"].predict_species]:", follows[x].predict_species); # test
offset += 1;
#for test in range(len(weights)): # 测试-输出距离权值结果
# print("[",test,"] weights:",weights[test][0],"\t",follows[weights[test][1]].toString());
# pass;
pass; ########## 三 计算预测准确率
rate = 0.0;
i = 0;
for i in range(sampleAmount,len(follows)):
if(follows[i].label_species == follows[i].predict_species):
rate += 1;
else:
print("[预测错误样本] follow[",i,"]:",follows[i].toString());
pass;
pass;
rate = rate / (sampleAll - sampleAmount);
print("预测准确率:",rate); if print_samples:
for i in range(0,len(follows)):
print(follows[i].toString());
pass;
pass; main(False,True);

    Iris.py

'Iris module [class] '

__author__ = 'Johnny Zen'

class Iris:
"""
Iris花(类) [Demo]
iris = Iris([5.1,3.5,1.4,0.2],"Iris-setosa");
print(iris.toString());
iris.setPredictSpecies('Iris-setosa');
print(iris.toString());
print(iris.label_species);
=======================
[features][5.1, 3.5, 1.4, 0.2] [label-species]Iris-setosa [predict-species]None
[features][5.1, 3.5, 1.4, 0.2] [label-species]Iris-setosa [predict-species]Iris-setosa
Iris-setosa
"""
features = [];
label_species = None; # 标记种类
predict_species = None; # 预测种类
def __init__(self,features,label_species=None):
if type(features).__name__ == 'list':
self.features = features;
else:
self.features = list(features); # 此list方法对list对象执行将产生错误
pass;
for x in range(len(self.features)): # 列表内元素字符串转实数
self.features[x] = float(self.features[x]);
self.label_species = label_species;
pass;
def setPredictSpecies(self,predict_species=None):#设置预测种类
self.predict_species = predict_species;
pass;
def toString(self):#与一般函数定义不同,类方法必须包含参数 self[第一个参数]
return "[features]" + str(self.features) + "\t[label]" + str(self.label_species + "\t[predict]" + str(self.predict_species));
pass;
pass;

    file_handle.py

"file_handle module [function]:read(filepath,ignore=0,mode='r')"

def read(filepath,ignore=0,mode='r'):
try:
file = open(filepath,mode);
## file_content = file.read();
file_content = '';
i = 0;
for i in range(0,ignore):
file.readline();
##print(i);
##print(file.readline());
for line in file.readlines():
file_content += line;
finally:
if file:
file.close();
#print(file_content);
return file_content;
pass;

四 参考文献

  [1] K-NN和K-Means算法

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