一、流程:
1.定义好每个原子力场类型:Edit Sets(分组)
2.加H(一般是仅与Al-O八面体中的Al相连的O原子)、给H分组
3.“make P1”、校核化学式(正确与否)
4.扩成超晶胞(Na-mmt:4*1*1,Ca-mmt:4*2*1,illite:2*1*1,由化学式而定)
5.置换阳离子:
mmt:模型中每 32 个 Si 4+有 1 个被 Al 3+ 取代,每 8 个 Al 3+ 有 1 个被 Mg 2+ 取代,因此晶格取代产生的层电荷为-0.75e/元胞,由层间
Na + 离 子 平 衡 。 建 立 的 蒙 脱 石 的 分 子 式 为 :Na 0.75 (Si 7.75 Al 0.25 )(Al 3.5 Mg 0.5 )O 20 (OH) 4 。
4a*b*c:Na 3 (Si 31 Al )(Al 14 Mg 2 )O 80 (OH) 16;所以,要用1个Al(at)去取代1个Si(st),注意,这里是四面体中的Al(at),不是八面体中的Al(ao);
以及2个Mg(mgo)去取代八面体中的2个Al(ao)。
层间阳离子:直接改,随机充填在层间域中(包括水分子)
6.调整c值、扩胞:根据实际需求来调整。
0——0.96nm(0个水分子);
1——1.25(32个水分子);
2——1.53(64个水分子);
3——1.85(96个水分子);
4——2.1(144个水分子)。
7.优化
8.计算