High Performance Computing (HPC) 使用指南

致谢:特别感谢王际潮的耐心指导

配置环境变量

vim ~/.bashrc 
i export PATH=/home/yupeng/anaconda3/bin:$PATH :wq
source ~/.bashrc

配置环境空间

conda create -n spacename python=3.8

启动环境空间

source activate bad

装包

pip install scipy

1.代码要使用相对路径编写

2.链接HPC

ssh hongzli2@burgundy.hpc.cityu.edu.hk

3.上传本地文件到服务器(新开一个cmd窗口,在本地cmd操作)
传输单个文件scp,传输文件夹scp -r.上传下载通用
scp 本地绝对路径 jichawang2@burgundy.hpc.cityu.edu.hk:/home/jichawang2

scp -r C:\Users\Administrator\Downloads\QuadraticKnapsack01GRASP-master hongzli2@burgundy.hpc.cityu.edu.hk:/home/hongzli2

4.sh文件编码问题

http://221.216.6.54:8085/clshpc/quession/shownews.php?id=67

5.一定要在source activate env进入指定之后,在使用sbatch命令提交sh文件进入job queue

sbatch sbatch_A.sh

6.CPU和GPU可以同时各运行一个程序,2个CPU程序只能排队运行

7.从服务器上下载文件(在本地cmd操作)
scp jichawang2@burgundy.hpc.cityu.edu.hk:/home/jichawang2/SAR 本地绝对路径
将服务器端的SAR文件夹全部拷贝至指定的绝对路径下。得到 绝对路径/SAR/…

8.可以终止自己的进程

scancel 82051 82052 85063

9.查看自己的队列

squeue -l

删除文件

rm -rf anaconda3/

查看文件

vim sbatch_A.sh
ESC :wq :q! i
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