从 RDD 创建 DataFrame
1. pandas df 与 spark df 的相互转换
import pandas as pd
import numpy as np
arr = np.arange(9).reshape(-1,3)
df_p = pd.DataFrame(arr)
arr
df_p
df_p.columns=['a','b','c']
df_p
df_s = spark.createDataFrame(df_p)
df_s.show()
df_s.collect()
df_s.toPandas()
2. Spark 与 Pandas 中 DataFrame 对比
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Pandas | Spark | |
工作方式 | 单机single machine tool,没有并行机制parallelism 不支持Hadoop,处理大量数据有瓶颈 |
分布式并行计算框架,内建并行机制parallelism,所有的数据和操作自动并行分布在各个集群结点上。以处理in-memory数据的方式处理distributed数据。 支持Hadoop,能处理大量数据 |
延迟机制 | not lazy-evaluated | lazy-evaluated |
内存缓存 | 单机缓存 | persist() or cache()将转换的RDDs保存在内存 |
DataFrame可变性 | Pandas中DataFrame是可变的 | Spark中RDDs是不可变的,因此DataFrame也是不可变的 |
创建 | 从spark_df转换:pandas_df = spark_df.toPandas() | 从pandas_df转换:spark_df = SQLContext.createDataFrame(pandas_df) 另外,createDataFrame支持从list转换spark_df,其中list元素可以为tuple,dict,rdd |
list,dict,ndarray转换 | 已有的RDDs转换 | |
CSV数据集读取 | 结构化数据文件读取 | |
HDF5读取 | JSON数据集读取 | |
EXCEL读取 | Hive表读取 | |
外部数据库读取 | ||
index索引 | 自动创建 | 没有index索引,若需要需要额外创建该列 |
行结构 | Series结构,属于Pandas DataFrame结构 | Row结构,属于Spark DataFrame结构 |
列结构 | Series结构,属于Pandas DataFrame结构 | Column结构,属于Spark DataFrame结构,如:DataFrame[name: string] |
列名称 | 不允许重名 | 允许重名 修改列名采用alias方法 |
列添加 | df[“xx”] = 0 | df.withColumn(“xx”, 0).show() 会报错 from pyspark.sql import functions df.withColumn(“xx”, functions.lit(0)).show() |
列修改 | 原来有df[“xx”]列,df[“xx”] = 1 | 原来有df[“xx”]列,df.withColumn(“xx”, 1).show() |
显示 | df 不输出具体内容,输出具体内容用show方法 输出形式:DataFrame[age: bigint, name: string] |
|
df 输出具体内容 | df.show() 输出具体内容 | |
没有树结构输出形式 | 以树的形式打印概要:df.printSchema() | |
df.collect() | ||
排序 | df.sort_index() 按轴进行排序 | |
df.sort() 在列中按值进行排序 | df.sort() 在列中按值进行排序 | |
选择或切片 | df.name 输出具体内容 | df[] 不输出具体内容,输出具体内容用show方法 df[“name”] 不输出具体内容,输出具体内容用show方法 |
df[] 输出具体内容, df[“name”] 输出具体内容 |
df.select() 选择一列或多列 df.select(“name”) 切片 df.select(df[‘name’], df[‘age’]+1) |
|
df[0] df.ix[0] |
df.first() | |
df.head(2) | df.head(2)或者df.take(2) | |
df.tail(2) | ||
切片 df.ix[:3]或者df.ix[:”xx”]或者df[:”xx”] | ||
df.loc[] 通过标签进行选择 | ||
df.iloc[] 通过位置进行选择 | ||
过滤 | df[df[‘age’]>21] | df.filter(df[‘age’]>21) 或者 df.where(df[‘age’]>21) |
整合 | df.groupby(“age”) df.groupby(“A”).avg(“B”) |
df.groupBy(“age”) df.groupBy(“A”).avg(“B”).show() 应用单个函数 from pyspark.sql import functions df.groupBy(“A”).agg(functions.avg(“B”), functions.min(“B”), functions.max(“B”)).show() 应用多个函数 |
统计 | df.count() 输出每一列的非空行数 | df.count() 输出总行数 |
df.describe() 描述某些列的count, mean, std, min, 25%, 50%, 75%, max | df.describe() 描述某些列的count, mean, stddev, min, max | |
合并 | Pandas下有concat方法,支持轴向合并 | |
Pandas下有merge方法,支持多列合并 同名列自动添加后缀,对应键仅保留一份副本 |
Spark下有join方法即df.join() 同名列不自动添加后缀,只有键值完全匹配才保留一份副本 |
|
df.join() 支持多列合并 | ||
df.append() 支持多行合并 | ||
缺失数据处理 | 对缺失数据自动添加NaNs | 不自动添加NaNs,且不抛出错误 |
fillna函数:df.fillna() | fillna函数:df.na.fill() | |
dropna函数:df.dropna() | dropna函数:df.na.drop() | |
SQL语句 | import sqlite3 pd.read_sql(“SELECT name, age FROM people WHERE age >= 13 AND age <= 19”) |
表格注册:把DataFrame结构注册成SQL语句使用类型 df.registerTempTable(“people”) 或者 sqlContext.registerDataFrameAsTable(df, “people”) sqlContext.sql(“SELECT name, age FROM people WHERE age >= 13 AND age <= 19”) |
功能注册:把函数注册成SQL语句使用类型 sqlContext.registerFunction(“stringLengthString”, lambda x: len(x)) sqlContext.sql(“SELECT stringLengthString(‘test’)”) |
||
两者互相转换 | pandas_df = spark_df.toPandas() | spark_df = sqlContext.createDataFrame(pandas_df) |
函数应用 | df.apply(f)将df的每一列应用函数f | df.foreach(f) 或者 df.rdd.foreach(f) 将df的每一列应用函数f df.foreachPartition(f) 或者 df.rdd.foreachPartition(f) 将df的每一块应用函数f |
map-reduce操作 | map(func, list),reduce(func, list) 返回类型seq | df.map(func),df.reduce(func) 返回类型seqRDDs |
diff操作 | 有diff操作,处理时间序列数据(Pandas会对比当前行与上一行) | 没有diff操作(Spark的上下行是相互独立,分布式存储的) |
http://www.lining0806.com/spark与pandas中dataframe对比/
3.1 利用反射机制推断 RDD 模式
- sc 创建 RDD
from pyspark.sql import Row
people = spark.sparkContext.textFile("file:///usr/local/spark/examples/src/main/resources/people.txt")
- 转换成 Row 元素,列名=值
people = people.map(lambda line:line.split(',')).map(lambda p:Row(name=p[0],age=int(p[1])))
- spark.createDataFrame 生成 df
schemaPeople = spark.createDataFrame(people)
schemaPeople.createOrReplaceTempView("people")
personsDF = spark.sql("select name,age from people where age>20")
personsRDD = personsDF.rdd.map(lambda p:"Name:"+p.name+","+"Age:"+str(p.age))
personsRDD.foreach(print)
- df.show(), df.printSchema()
schemaPeople.show()
schemaPeople.printSchema()
3.2 使用编程方式定义 RDD 模式
- 生成“表头”
- fields = [StructField(field_name, StringType(), True) ,...]
- schema = StructType(fields)
from pyspark.sql.types import StringType,StructField,StructType
from pyspark.sql import Row
schemaString = "name age"
fields = [StructField(field_name,StringType(),True) for field_name in schemaString.split(" ")]
schema = StructType(fields)
fields
schema
- 生成“表中的记录”
- 创建 RDD
- 转换成 Row 元素,列名=值
lines = spark.sparkContext.textFile("file:///usr/local/spark/examples/src/main/resources/people.txt")
parts = lines.map(lambda x:x.split(","))
people = parts.map(lambda p:Row(p[0],p[1].strip()))
people.collect()
- 把“表头”和“表中的记录”拼装在一起
- = spark.createDataFrame(RDD, schema)
schemaPeople = spark.createDataFrame(people,schema)
schemaPeople.show()
schemaPeople.printSchema()
4. DataFrame 保存为文件
df.write.json(dir)
schemaPeople.write.json("file:///usr/local/spark/schema_out")