论文解读(DAEGC)《Improved Deep Embedded Clustering with Local Structure Preservation》

Paper Information

Title:《Attributed Graph Clustering: A Deep Attentional Embedding Approach》
Authors:Chun Wang、Shirui Pan、Ruiqi Hu、Guodong Long、Jing Jiang、C. Zhang
Source:2019, IJCAI
Other:96 Citations, 42 References
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Task:Graph Clustering、Graph Embedding、Node Clustering


Abstract

  该方法侧重于属性图的构建,并使用 attention network 描述邻居节点对 target node 的重要性。


1 Introduction

  目前研究现状:基于图表示学习的方法都是两阶段的方法 。

  总结目前研究:重构拓扑结构以及重建节点表示的方法。

  研究缺陷:拓扑结构和节点表示融合机制并不完美。

  本文模型:$\text{DAEGC}$ [ a goal-directed graph attentional autoencoder based attributed graph clustering framework ]

  重建节点表示:采用 $\text{graph attentional autoencoder }$:

    • $\text{Encoder}$ 可以同时学习节点内容以及图结构 ;
    • $\text{Decoder}$ 重建图拓扑结构 ;

  训练模型:自训练模型 [ 高置信度分布指导模型训练 ]

  本文模型与传统的 $\text{two-step}$ 方法的比较如 Figure 1 所示:  

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  • 本文模型是将 $\text{node embedding}$ 和聚类放在一个统一的框架中学习。
  • $\text{Two-step}$ 方法则是先学习 $\text{node embedding}$,然后进行聚类。 

  本文贡献:

    • 第一个提出图注意自编码器;
    • 提出了基于 $\text{goal-directed}$ 的图聚类框架;

2 Related Work

2.1 Graph Clustering

  阐述早起方法的不顶用,以及感谢深度方法对图聚类的发展。

2.2 Deep Clustering Algorithms

  铭记 DEC 深度聚类。


3 Problem Definition and Overall Framework

  $\text{Graph basic definition}$ :略。

  给定图 $G$,图聚类的目的是将  $G$  中的节点划分为  $k$  个不相交  $\text{groups}$: ${G_1、G_2、···、G_k}$,使在同一  $\text{group}$ 的节点满足两个条件:

    • 彼此图结构相似 ;[ 社区结构类似 ]
    • 节点属性相似 ;

  本文模型框架包括两个部分,如 Fig 2 所示 :

    • Graph Attentional Autoencoder :AE 以属性值和图结构作为输入,并通过最小化重构损失来学习潜在的 representation ;
    • Self-training Clustering :根据学习到的 representation 进行聚类,并根据聚类结果对潜在 representation 进行操作; 

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  该框架将学习 graph embedding 和执行聚类放在一个统一的框架中,因此可以使每个组件彼此受益。


4 Proposed Method

  本节先阐述 graph attentional autoencoder  [ 有效的学习图结构和 content information ] 生成 latent representation,然后阐述 self-training module 指导聚类。

4.1 Graph Attentional Autoencoder

  Graph Attentional Autoencoder:通过关注每个节点的邻居来学习每个节点的 latent representation ,从而将 attribute values 与图结构信息 融入 latent representation。

  首先:衡量 $\text{node}$ $i$ 的邻居 $N_i$  对于 $\text{node}$ $i$ 的影响,这里考虑的是不同邻居对 $\text{node}$ $i $ 的影响不一样,主要体现在对邻居赋予不同的权重。

    $z_{i}^{l+1}=\sigma\left(\sum\limits _{j \in N_{i}} \alpha_{i j} W z_{j}^{l}\right)\quad\quad\quad(1)$

  其中:

    • $z_{i}^{l+1}$  denotes the output representation of node  $i$ ;
    • $N_{i}$  denotes the neighbors of  $i$ ;
    • $\alpha_{i j}$  is the attention coefficient that indicates the importance of neighbor node  $j$  to node  $i$ ;
    • $\sigma$  is a nonlinerity function ;

  对于 attention 系数   $\alpha_{i j}$ [ 重要度 ] 主要参考两个方面:

    1. 属性值(attribute values) ;
    2. 拓扑距离( topological distance );

  Aspact 1:属性值

  attention 系数 $\alpha_{i j}$ 可以表示为 由 $x_i$ 和 $x_j$ 拼接形成的单层前馈神经网络:

    $c_{i j}=\vec{a}^{T}\left[W x_{i} \| W x_{j}\right]\quad \quad \quad(2)$

  其中:

    • $\vec{a} \in R^{2 m^{\prime}}$ 是权重向量;  

  Aspact 2:拓扑距离

  在 AE 的 $\text{Encoder}$ 中考虑高阶邻居信息(这里指 $ \text{t-order} $ 邻居),得到  $\text{proximity matrix} $ :

    $M=\left(B+B^{2}+\cdots+B^{t}\right) / t\quad \quad\quad(3)$

  其中:

    • $B$ 是转移矩阵(transition matrix),当  $e_{i j} \in E$  有边相连,那么  $B_{i j}=1 / d_{i}$  ,否则  $B_{i j}=0$ 。
    • $M_{i j}$  表示 $\text{node}$  $i$ 和 $\text{node}$  $j$ 的 $t$  阶内的拓扑相关性。这意味着 如果 $\text{node}$  $i$ 和 $\text{node}$  $j$ 存在邻居关系($t$ 阶之内),那么  $M_{i j}>0 $。

  通常对每个 $\text{group}$ 中的 $\text{node}$ 做标准化:采用 $\text{softmax function}$ 

    ${\large \alpha_{i j}=\operatorname{softmax}_{j}\left(c_{i j}\right)=\frac{\exp \left(c_{i j}\right)}{\sum_{r \in N_{i}} \exp \left(c_{i r}\right)}} \quad \quad \quad(4)$

  将 $\text{Eq.2}$ 中 $c_{ij}$ 带入,并添加上 $\text{topological weights }$  $M$ 和激活函数  $\delta$ ,那么  $\text{attention}$ 系数可以表示为:

    ${\large \alpha_{i j}=\frac{\exp \left(\delta M_{i j}\left(\vec{a}^{T}\left[W x_{i} \| W x_{j}\right]\right)\right)}{\sum_{r \in N_{i}} \exp \left(\delta M_{i r}\left(\vec{a}^{T}\left[W x_{i} \| W x_{r}\right]\right)\right)}} \quad\quad\quad(5)$

  其中

    • 激活函数 $\delta$ 采用 $LeakyReLU$ ;
    • $x_{i}=z_{i}^{0}$ 作为问题的输入 ;

  这里我们堆叠 $2$ 个 $\text{graph attention layers}$ :

    $z_{i}^{(1)}=\sigma\left(\sum \limits _{j \in N_{i}} \alpha_{i j} W^{(0)} x_{j}\right)\quad \quad \quad (6)$

    $z_{i}^{(2)}=\sigma\left(\sum\limits _{j \in N_{i}} \alpha_{i j} W^{(1)} z_{j}^{(1)}\right)\quad \quad\quad(7)$

  到这就 Encoder 就编码了 结构信息和属性信息(node attributes),并且我们最终的 $z_{i}=z_{i}^{(2)}$ 。

Inner product decoder

  本文采用了简单的  $\text{Inner product decoder}$ [ 输入已经包括了属性值和拓扑结构 ] 去预测节点之间的连接:

    $\hat{A}_{i j}=\operatorname{sigmoid}\left(z_{i}{ }^{\top} z_{j}\right)\quad \quad \quad (8)$

  其中:

    • $\hat{A}$ 是重建后的图结构矩阵;  

Reconstruction loss

  通过最小化度量 $A$ 和 $\hat{A}$ 重构错误:

    $L_{r}=\sum\limits _{i=1}^{n} \operatorname{loss}\left(A_{i, j}, \hat{A}_{i j}\right)\quad\quad \quad (9)$ 

4.2 Self-optimizing Embedding

  除了优化重构误差外,我们还将 hidden embedding 输入一个自优化聚类模块,该模块最小化以下目标:

    $L_{c}=K L(P \| Q)=\sum\limits_{i} \sum\limits _{u} p_{i u} \log \frac{p_{i u}}{q_{i u}}\quad\quad\quad(10)$

其中:

  • $q_{iu}$度量 node embedding $z_{i}$ 和 cluster center embedding $\mu_{u}$ 之间的相似性,本文通过 Student's t-distribution 度量。同时它可以看作是每个节点的一个软聚类分配分布。;
  • $p_{iu}$ 代表着目标分布,由于在Q中,具有高概率的软分配(靠近集群中心的节点)被认为是可信的,所以考虑将 $Q$ 提高到二次方,以增加高可信度;

    ${\large q_{i u}=\frac{\left(1+\left\|z_{i}-\mu_{u}\right\|^{2}\right)^{-1}}{\sum\limits _{k}\left(1+\left\|z_{i}-\mu_{k}\right\|^{2}\right)^{-1}}} \quad\quad\quad(11)$

    ${\large p_{i u}=\frac{q_{i u}^{2} / \sum_{i} q_{i u}}{\sum_{k}\left(q_{i k}^{2} / \sum_{i} q_{i k}\right)}}\quad \quad\quad(12) $

  聚类损失迫使当前分布  $Q$  接近目标分布 $P$,从而将这些  “confident assignments”  设置为软标签来监督  $Q$  的嵌入学习。

  算法概述

    • 首先使用没有用 selfoptimize clustering part 的自编码器获得初始 embedding ;
    • 其次为计算  Eq.11 ,先使用 $k-means$ 获得初始聚类中心 $\mu$  
    • 然后根据 $L_c$  使用 SGD 进行优化更新 $\mu$ 和 $z$ 。

  需要注意的是 :$P$ 每 $5$ 个 iteration 更新一次,$Q$ 每个 iteration 更新一次。

  算法步骤:

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4.3 Joint Embedding and Clustering Optimization

  我们联合优化了自动编码器的嵌入和聚类学习,并定义了我们的总目标函数为:

    $L=L_{r}+\gamma L_{c}\quad \quad\quad (13)$

  其中:

    • $L_{r}$ 代表着 reconstruction loss  ;
    • $L_{c} $ 代表着 clustering loss ;
    • $ \gamma \geq 0 $ 控制着 $L_{r}$ 和  $L_{c} $ 的平衡 ;

  最终 $v_{i}$ 的 soft label 通过 $Q$ 获得:

    $s_{i}=\arg \underset{u}{\text{max}} \; q_{i u}\quad \quad\quad(14)$

  我们的算法有以下优点

    • Interplay Exploitation :structure and content information ;
    • Clustering Specialized Embedding:self-training clustering component ;
    • Joint Learning:Jointly optimizes the two parts of the loss functions ;

5 Experiments

5.1 Results

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6 Conclusion

  在本文中,我们提出了一种无监督的深度注意嵌入算法DAEGC,以在一个统一的框架中联合执行图聚类和学习图嵌入。学习到的图嵌入集成了结构信息和内容信息,专门用于聚类任务。虽然图的聚类任务自然是无监督的,但我们提出了一个自训练的聚类组件,它从“自信的”分配中生成软标签来监督嵌入的更新。对聚类损失和自编码器重构损失进行联合优化,同时得到图嵌入和图聚类结果。将实验结果与各种先进算法的比较,验证了DAEGC的图聚类性能。

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