在Windows系统下用命令把应用程序添加到系统服务，使用SC命令。

加入服务格式如下：
sc create ServiceName binPath= 程序路径 start= auto
（等号后面的空格是必需的）

删除服务格式如下：
sc delete ServiceName

举个例子，将FlashFXP加入到系统服务中（假设 FlashFXP 安装在 D:\Program Files\FlashFXP 文件夹）。
sc create FlashFXP binPath= D:\Program Files\FlashFXP\FlashFXP.exe start= auto

要删除FlashFXP这个服务的话，只需要执行一下命令就可以了。
sc delete FlashFXP

想了解关于SC命令的详解，请自行查看帮助（sc /?)），或者去网上自己查找下资料。