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推荐：
- VS2012 使用 1.0.84 版的库
- VS2013 使用 1.0.93 版的库
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1、安装运行库
sqlite-netFx45-setup-bundle-x64-2012-1.0.84.0.exe
sqlite-netFx45-setup-bundle-x86-2012-1.0.84.0.exe（最新的测试，64位系统，只要装这个就行了）
选安装到GAC，集成到VS2012（或VS2013）
2、创建各项目，VS2012项目的.NET版本选4.5，VS2013项目的.NET版本选4.5.1
3、安装nuget
1 install-package EntityFramework -version 5.0 2 install-package System.Data.SQLite -version 1.0.84
（最新的测试，64位系统，这步也不需要）
4、修改app.config/web.config（不加会提示：指定的存储区提供程序在配置中找不到）
（最新的测试，这些不加也行，灵异了）
<system.data> <DbProviderFactories> <remove invariant="System.Data.SQLite"/> <add name="SQLite Data Provider" invariant="System.Data.SQLite" description=".Net Framework Data Provider for SQLite" type="System.Data.SQLite.SQLiteFactory, System.Data.SQLite, Version=1.0.84.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=db937bc2d44ff139" /> </DbProviderFactories> </system.data>
5、正常添加edmx即可在项目中操作SQLite数据库。
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最新的测试，上面很多步骤都不需要：
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1、只要安装x86的运行库即可（VS2012用1.0.84.0，VS2013用1.0.93.0）
2、创建一个ClassLibrary的models项目库
3、在项目库中即可添加edmx（T4或默认模板都没问题）
4、mvc3/4项目和console项目，直接引用models项目库
5、mvc项目修改web.config，console项目修改app.config，添加连接字符串
6、mvc项目修改views\web.config添加对models项目库的namespace引用
7、然后就可以在项目中正常访问sqlite数据库了
注意：T4模板（生成独立的POCO类）的edmx可以直接使用，默认模板（所有类全生成在designer.cs中）的edmx在引用的项目中需要修改web.config：
<compilation debug="true" targetFramework="4.0"> <!-- 这里也可能是4.5，VS2013是4.5.1，根据项目需要 --> <assemblies> <add assembly="System.Data.Entity, Version=4.0.0.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=B77A5C561934E089" /> </assemblies> </compilation>
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附注：SQLite 查询出错 IndexOutOfRange，是缺少字段，或者字段名错误。
p.s. 写了个小测试项目，放在东京代码库里了。