Pandas进阶之提速遍历操作

2024-01-02 21:42:40

一、概念

pandas是基于numpy库的数组结构构建的，它的很多操作都是（通过numpy或者pandas自身由Cpython实现并编译成C的扩展模块）在C语言中实现的。因此，正确使用pandas，它的运行速度是非常快的。
本篇介绍几种pandas中常用的提升运行速度的方法
1）将datetime数据与时间序列一起使用的优点
2）进行批量计算的最有效途径

二、使用Datetime数据节省时间

通常创建DataFrame时，或从txt、excel中读取数据时，如果没有特殊声明，那么date_time将会成为默认的object类型，实际上，pandas和numpy都有一个dtypes的概念，可以设置数据类型；

df = pd.read_csv("speed_promotion.csv")

df.head()
   type                 id                      amount      dt
0   QY  ac89c667-8d21-454f-b205-49e3d5ba4920    38000.0 2018/9/21 0:00
1   XYY 0cb72f4d-0059-43ac-a326-6fcf33e55632    85196.1 2019/1/29 0:00
2   QY  6937fdb5-bef7-419a-a633-7f58f664c9cc    33000.0 2018/8/29 0:00
3   QY  05b75e08-f2fe-4610-87ec-15ada55a1685    54000.0 2018/12/21 0:00
4   QY  1e9f8e40-67f9-4882-8935-4e10c5b6258f    32000.0 2018/12/21 0:00

df.dtypes
type       object
id         object
amount    float64
dt         object        # date_time，默认成了object类型
dtype: object

object 类型像一个大的容器，不仅仅可以承载 str，也可以包含那些不能很好地融进一个数据类型的任何数据列，如果我们将日期作为 object 类型就会极大的影响效率；
对于时间序列的数据而言，要将date_time列格式化为datetime对象数组，pandas称之为时间戳，使用pd.to_datetime()函数即可简单实现；

df["dt"] = pd.to_datetime(df["dt"])

df.dtypes
type              object
id                object
amount           float64
dt        datetime64[ns]
dtype: object

特别地，如果数据源中的date_time不是ISO 8601 格式的，需要设置pd.to_datetime()中的format参数，进行格式化，否则pandas将使用dateutil 包把每个字符串str转化成date日期，速度并不是最快的，只有当date_time是ISO 8601 格式，pandas才可以立即使用最快速的方法来解析日期。

三、pandas数据的循环操作

基于上面的数据，如果需要根据amount列的值，构造一个新的列，要求：
0 < 金额 <= 10000，返回：金额 * 0.3
10000 < 金额 <= 100000，返回：金额 * 0.5
100000 < 金额 <= 1000000，返回：金额 * 0.8
常规的代码做法(不赞同该做法)

定义一个判断函数，写好条件的逻辑代码

def judge_amount(amount, rate):
    """计算不同投资区间的收益"""
    
    if amount >0 and amount <= 10000:
        rate = 0.3
    elif amount > 10000 and amount <= 100000:
        rate = 0.5
    elif amount > 100000 and amount <= 1000000:
        rate = 0.8
    else:
        raise ValueError(f"Invalid amount: {amount}")
    return amount * rate

使用for循环来遍历df，根据判断函数逻辑，添加新的数据列

def add_judge_amount(df):
    """根据金额判断区间，为df增加新列"""
    
    add_list = []
    for i in range(len(df)):
        amt = df.iloc[i]["amount"]
        income = judge_amount(amt)
        add_list.append(income)
    df["income"] = add_list

# 打印运行时间
%timeit add_judge_amount(df)
5.59 s ± 190 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)

对于写Pythonic风格的人来说，这个设计看起来很自然。然而，这个循环会严重影响效率，时间成本太高，不赞同这么做。原因：
它需要初始化一个将记录输出的列表；
它使用不透明对象范围(0, len(df))循环，然后在应用judge_amount()之后，必须将结果附加到用于创建新DataFrame列的列表中；
它使用df.iloc [i] ['amount']执行所谓的链式索引，这通常会导致意外的结果；

使用itertuples() 和iterrows() 循环

itertuples()函数和iterrows()函数，是pandas内置的进行遍历循环的方法，可以使遍历的效率更快一些，因为这些都是一次产生一行的生成器方法，类似scrapy中使用的yield用法；

def add_judge_amount_iter(df):
    """根据判断区间，为df增加新列"""
    
    add_list = []
    for index, row in df.iterrows():
        amt = row["amount"]
        income = judge_amount(amt)
        add_list.append(income)
    df["income"] = add_list

# 打印运行时间
%timeit add_judge_amount_iter(df)
2.68 s ± 8.87 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)

对比常规做法
语法更明确，行值引用中的混乱更少，因此它更具可读性；
时间方面，快了1倍！
还有改进的空间，因为仍然在使用某种形式的Python for循环，这意味着每个函数调用都是在Python中完成的，理想情况是它可以用Pandas内部架构中内置的更快的语言完成；

使用apply()

Pandas.apply()方法接受函数(callables)并沿DataFrame的轴(所有行或所有列)应用它们；
通过apply() + lambda的方式，lambda函数将amount列传递给了定义的方法judge_amount()；

# 打印运行时间
%timeit df["income"] = df["amount"].apply(lambda x: judge_amount(x))
13.5 ms ± 113 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100 loops each)

Pandas.apply()的语法优点很明显，行数少，代码可读性高；
对比iterrows()函数，apply()函数所花费的时间，从2.68s提升到了13.5ms，提升了200倍；
其实，这还不算是“非常快”，原因是apply()将在内部尝试循环遍历Cython迭代器，而传递的lambda并不是可以在Cython中处理的东西，它需要在Python中调用，因此并不是那么快，特别是当数据量非常大的时候。

矢量化操作

什么是矢量化操作？如果不需要基于一些条件，而是可以在一行代码中将所有金额应用于固定收益率(df["amount"]*rate)，类似这种。这个特定的操作就是矢量化操作的一个例子，它是在Pandas中执行的最快方法；
进行矢量化操作的一个技巧是，根据指定的条件选择和分组DataFrame，然后对每个选定的组进行矢量化操作；
当条件是对取值范围区间的限定时，通过pd.cut()函数可以很好地实现矢量操作。也可以将取值范围的列设置为索引，通过isin()函数进行范围判断，生成一系列布尔数组，传递给DataFrame的.loc索引器，获取符合范围的切片，进行分组矢量运算；

%timeit df["income"] = df.amount * pd.cut(df.amount, bins=[0, 10000, 100000, 1000000], labels=[0.3, 0.5, 0.8]).astype("float")
2.93 ms ± 46.4 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100 loops each)

矢量操作，花费时间基本已经快达到极限了，速度比apply()函数提升了4倍多。而且不需要再定义任何函数，更加简便；
使用pd.cut()函数时，返回的是分类类型Categorical，需要转化成数值才能运算；
还能不能再快？因为Pandas可以与NumPy阵列和操作无缝衔接，其实，通过Numpy的digitize()函数还可以加速，它类似于Pandas的cut()。虽然仍有性能上的提升，但它本质上变得更加边缘化(没有必要)，而且使用Pandas，它可以帮助维持“层次结构”。

数据循环方法排名

使用向量化操作：没有for循环的Pandas方法和函数；
将apply()方法：与可调用方法一起使用；
使用itertuples()或iterrows()，从Python的集合模块迭代DataFrame行；
使用“element-by-element”循环：使用df.loc或df.iloc一次更新一个单元格或行。

作者：惑也
链接：https://www.jianshu.com/p/56a50a6c961c
来源：简书
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一、概念

二、使用Datetime数据节省时间

三、pandas数据的循环操作

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