pycaffe简明文档
by ChrisZZ, imzhuo@foxmail.com
2018年01月18日19:00:56
说明
caffe的python接口没有官方说明文档，例如查看一个函数的用法，pytorch能查到所有的用法，而pycaffe则需要自行去查看源码。于是手动写了一个很粗糙的文档，凑合看了。
1.主要根据caffe_root/python/caffe目录下的__init__.py和_caffe.cpp来手动生成。
2.以及caffe_root/python/proto/caffe_pb2.py文件（这个文件是从caffe.proto来的，特别大）。
3.还有就是caffe_root/python/caffe/test目录下的这些单元测试文件。
4.其他文件，如io.py, net_spec.py, pycaffe.py, draw.py, classifier.py, detector.py，要么是caffe_pb2.py中众多函数的重要的、有代表性的基本封装和使用，要么就是充当（可能）常用的工具。
5.此外，老版本(如caffe-fast-rcnn)和新版本(如caffe-BVLC)的pycaffe支持的东西，肯定是新版本的多一些。本文档仅仅列出了caffe-fast-rcnn版代码中的函数，更新版本pycaffe中的函数需要自行查看_caffe.cpp做对照理解。
也是醉了，其实可以直接查看从代码和注释生成的文档的：
#在ipython环境下
import caffe
help(caffe.Net)
help(caffe.proto.caffe_pb2)
这里是模板：
className类
className.funcName(param1, param2)
@param1 类型，作用
@param2 类型，作用
@descipion 函数的作用是，
@return 类型
caffe.Net类
__init__(prototxt, phase)
@param prototxt: 字符串。指定prototxt路径
@param phase: `caffe.TRAIN`或者`caffe.TEST`
@description: 根据prototxt初始化一个网络。相当于C++的:
shared_ptr<Net<Dtype> > net(new Net<Dtype>(param_file,
static_cast<Phase>(phase)));
@return `Net`类对象，网络实例
@example `net = caffe.Net('test.prototxt', caffe.TEST)`
__init__(prototxt, caffemodel, phase)
@param prototxt: 字符串。指定prototxt路径
@param caffemodel: 字符串，指定caffemodel路径
@param phase: `caffe.TRAIN`或者`caffe.TEST`
@description: 根据prototxt初始化一个网络，并从caffemodel复制同名层的权值（作为网络中该层的权值）。相当于C++的：
shared_ptr<Net<Dtype> > net(new Net<Dtype>(param_file,
static_cast<Phase>(phase)));
net->CopyTrainedLayersFrom(pretrained_param_file);
@return `Net`类对象，网络实例
@example `net = caffe.Net('test.prototxt', 'resnet50.caffemodel', caffe.TEST)`
_forward(start, end)
@param start: int类型
@param end: int类型
@description: 执行前向传播。调用的是C++的`Dtype Net<Dtype>::ForwardFromTo(int start, int end) `
@return: loss值
@example: 类的私有方法，所以不建议使用
_backward(start, end)
@param start: int类型
@param end: int类型
@description: 执行前向传播。调用的是C++的`void Net<Dtype>::BackwardFromTo(int start, int end) `
@return: 没有返回值。
@example: 类的私有方法，所以不建议使用
reshape()
@param: 不需要参数
@description: 网络中的每一层，都执行reshape。调用的C++的`void Net<Dtype>::Reshape() `
@return: 没有返回值类型
copy_from(caffemodel)
@param caffemodel: 字符串类型。指定(pretrained的)caffemodel路径
@description: 读取指定的caffemodel(二进制protobuf文件），从中读取和当前网络同名层的参数作为替代。调用的是C++`void Net<Dtype>::CopyTrainedLayersFrom(const string trained_filename)`
@return: 空
@example
pretrained_caffemodel = 'abc.caffemodel'
net = caffe.Net(prototxt, caffe.TEST)
net.copy_from(pretrained_caffemodel)
(来源：py-faster-rcnn)
copy_from(net)
@param net: (另一个)Net对象
@description: 从Net中读取同名网络层参数作为替代。调用的其实是`void Net<Dtype>::CopyTrainedLayersFrom(const NetParameter& param)`
@return 空
@example
net = caffe.Net(prototxt, caffe.TEST)
resnet = caffe.Net(prototxt_resnet, caffemodel, caffe.TEST)
net.copy_from(resnet)
share_with(net)
@param net: Net类型。打算从net上取同名层，和当前网络共享参数。
@description: 和copy_from非常像。区别在于，被share的两个Net对象，同名层的数据是共享的！也就是内存中只有一份！改了一个，另一个也被修改！调用的是C++`void Net<Dtype>::ShareTrainedLayersWith(const Net* other) `
@return 空
_blob_loss_weights
私有属性。
返回loss函数中的每个blob的权值。按照blob_id进行索引。
_bottom_ids(i)
@param i: 层(layer)序号
@return 第i层的bottom们的id列表，`bottom_id_vecs_[i]`
_top_ids(i)
@param i: 层(layer)序号
@return 第i层的top们的id列表，`top_id_vecs_[i]`
_blobs
私有属性
返回blobs（不是很懂！）
layers
公共属性
返回layers
_blob_names
私有属性
返回blob们的名字
_layer_names
私有属性
返回layer们的名字
_inputs
私有属性。
返回`net_input_blob_indices_`，也就是网络输入们的索引们
_outputs
私有属性。
返回`net_output_blob_indices_`，也就是网络输出们的索引们
_set_input_arrays(?)
私有函数。
设定网络输入？（不懂）
save(pth)
@param pth: 字符串类型。指定保存的路径。
@description： 保存当前网络对象到文件（磁盘）。调用的是C++`void Net_Save(const Net<Dtype>& net, string filename) `
caffe.Blob类
一开始我觉得这个类在pycaffe中没有被暴露出来，因此没用。
其实不是的。
某个layer的top或者bottom，其实都是Blob的实例。那么这些blob就需要查看相对应的属性、函数。
shape
公开属性
返回当前blob对象(也就是一个tensor)的各个维度信息
常见的：返回N,C,H,W
num
公开属性
Deprecated legacy shape accessor num: use shape(0) instead.
channels
公开属性
Deprecated legacy shape accessor channels: use shape(1) instead.
height
公开属性
Deprecated legacy shape accessor height: use shape(2) instead.
width
公开属性
Deprecated legacy shape accessor width: use shape(3) instead.
count
公开属性
返回的是当前blob的维度数目，相当于len(self.shape)
比如，对于(N,C,H,W)维度的blob，返回的是4
reshape(shape_args)
公开函数
执行reshape操作
例子：
im = np.array(caffe.io.load_image('catGray.jpg', color=False)).squeeze()
im_input = im[np.newaxis, np.newaxis, :, :]
net.blobs['data'].reshape(*im_input.shape)
net.blobs['data'].data[...] = im_input
data
公开属性
本质是`Blob<Dtype>::mutable_cpu_data`
diff
公开属性
本质是`Blob<Dtype>::mutable_cpu_diff`
caffe.Layer类
blobs
公开属性
返回blobs
setup()
reshape()
phase
公开属性
层的phase
type
公开属性
层的type(？？干什么用的？）
caffe.Solver类
这个类没有被直接暴露出来使用，而是被作为SGDSolver等子类继承。因此子类中也有这些方法和属性可用，需要查看。
注意
caffe.Solver类没有构造函数！
但是caffe.Solver类的子类(例如caffe.SGDSolver)是有构造函数的！
net
公开属性
Solver所拥有的net对象
test_nets
公开属性
Solver所拥有的所有测试网络（因此是一个列表）
iter
公开属性
Solver对象当前迭代次数
solve(resume_file=None)
公开函数
让当前Solver对象执行求解，也就是执行所有iter。
如果指定`resume_file`那么从该文件继续执行（而不是从0次iter执行)
step(iters)
公开函数
@param iters: 需要执行的迭代次数
@description: 从Solver的当前迭代次数(self.iter)开始，执行iters次迭代。迭代期间可能输出“平滑过的loss"(smoothed_loss)，形如：
Iteration 20, loss = 3.66
具体见solver.cpp的`void Solver<Dtype>::UpdateSmoothedLoss(Dtype loss, int start_iter,
int average_loss)`函数
@return: 空
@example: solver.step(1) #执行一次迭代
restore(state_file)
公开函数
@param state_file: 字符串类型。暂存状态文件的路径。
@description: 从指定的暂存文件state_file中读取(恢复)状态。
snapshot()
公开函数
@description: 将当前solver的网路状态写入暂存文件(solver_state文件)
说明：暂存文件的名字是根据如下规则得到(C++):
`param_.snapshot_prefix() + "_iter_" + caffe::format_int(iter_) + ".caffemodel";`
可以通过python代码进行查看(甚至修改snapshot的前缀??):
from caffe.proto import caffe_pb2
solver_param = caffe_pb2.SolverParameter()
print(solver_param.snapshot_prefix)
注意2(TODO):
caffe.SGDSolver.restore(), caffe.Net.copy_from(), caffe.SGDSolver.copy_from(), caffe.SGDSolver.step()等函数，使用前请参考https://github.com/BVLC/caffe/issues/3336
caffe.SGDSolver类
caffe.Solver类的子类
__init__(filename)
@param filename: 字符串类型，指定SGDSolver的prototxt描述文件
@descrition 从指定的prototxt文件，创建SGDSolver
@example
solver_prototxt = 'resnet-50-test.prototxt'
self.solver = caffe.SGDSolver(solver_prototxt)
caffe.NesterovSolver类
caffe.Solver类的子类
__init__(filename)
同SGDSolver的构造函数
caffe.AdaGradSolver类
caffe.Solver类的子类
__init__(filename)
同SGDSolver的构造函数
caffe.RMSPropSolver类
caffe.Solver类的子类
__init__(filename)
同SGDSolver的构造函数
caffe.AdaDeltaSolver类
caffe.Solver类的子类
__init__(filename)
同SGDSolver的构造函数
caffe.AdamSolver类
caffe.Solver类的子类
__init__(filename)
同SGDSolver的构造函数
caffe.get_solver(filename)
公开函数
@param filename: 字符串类型。指定的solver文件
@description: 从指定的solver文件，创建solver
caffe.set_mode_cpu()
caffe.set_mode_gpu()
caffe.set_device(gpu_id)
@param gpu_id: int类型
设定(gpu)id。从0开始。即：第一块显卡是0，第二块显卡是1.
caffe.set_random_seed()
设定随机数种子。
好处：在重复实验的时候，尽量减少随机性。（但其实仅仅是种子一致，无法随机数出现顺序是一样的，因此最后inference结果还是会不一样，只不过波动性小了）
caffe.layer_type_list()
返回各个Layer的类型
caffe.proto.caffe_pb2包
这个包下面有很多类。但是很多（也许是全部？）都是从caffe.proto生成的，感觉很蛋疼啊，一个一个的写，肯定写不完的。
大概总结有这些：LayerNameParameter型，例如：SliceParameter
其他类：
反正，感觉都是在caffe.proto中通过message声明的一个个东西，例如：
caffe.proto.caffe_pb2.SolverParameter类
message SolverParameter {
//////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
// Specifying the train and test networks
//
// Exactly one train net must be specified using one of the following fields:
// train_net_param, train_net, net_param, net
// One or more test nets may be specified using any of the following fields:
// test_net_param, test_net, net_param, net
// If more than one test net field is specified (e.g., both net and
// test_net are specified), they will be evaluated in the field order given
// above: (1) test_net_param, (2) test_net, (3) net_param/net.
// A test_iter must be specified for each test_net.
// A test_level and/or a test_stage may also be specified for each test_net.
//////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
// Proto filename for the train net, possibly combined with one or more
// test nets.
optional string net = 24;
// Inline train net param, possibly combined with one or more test nets.
optional NetParameter net_param = 25;
optional string train_net = 1; // Proto filename for the train net.
repeated string test_net = 2; // Proto filenames for the test nets.
optional NetParameter train_net_param = 21; // Inline train net params.
repeated NetParameter test_net_param = 22; // Inline test net params.
// The states for the train/test nets. Must be unspecified or
// specified once per net.
//
// By default, all states will have solver = true;
// train_state will have phase = TRAIN,
// and all test_state's will have phase = TEST.
// Other defaults are set according to the NetState defaults.
optional NetState train_state = 26;
repeated NetState test_state = 27;
// The number of iterations for each test net.
repeated int32 test_iter = 3;
// The number of iterations between two testing phases.
optional int32 test_interval = 4 [default = 0];
optional bool test_compute_loss = 19 [default = false];
// If true, run an initial test pass before the first iteration,
// ensuring memory availability and printing the starting value of the loss.
optional bool test_initialization = 32 [default = true];
optional float base_lr = 5; // The base learning rate
// the number of iterations between displaying info. If display = 0, no info
// will be displayed.
optional int32 display = 6;
// Display the loss averaged over the last average_loss iterations
optional int32 average_loss = 33 [default = 1];
optional int32 max_iter = 7; // the maximum number of iterations
// accumulate gradients over `iter_size` x `batch_size` instances
optional int32 iter_size = 36 [default = 1];
// The learning rate decay policy. The currently implemented learning rate
// policies are as follows:
// - fixed: always return base_lr.
// - step: return base_lr * gamma ^ (floor(iter / step))
// - exp: return base_lr * gamma ^ iter
// - inv: return base_lr * (1 + gamma * iter) ^ (- power)
// - multistep: similar to step but it allows non uniform steps defined by
// stepvalue
// - poly: the effective learning rate follows a polynomial decay, to be
// zero by the max_iter. return base_lr (1 - iter/max_iter) ^ (power)
// - sigmoid: the effective learning rate follows a sigmod decay
// return base_lr ( 1/(1 + exp(-gamma * (iter - stepsize))))
//
// where base_lr, max_iter, gamma, step, stepvalue and power are defined
// in the solver parameter protocol buffer, and iter is the current iteration.
optional string lr_policy = 8;
optional float gamma = 9; // The parameter to compute the learning rate.
optional float power = 10; // The parameter to compute the learning rate.
optional float momentum = 11; // The momentum value.
optional float weight_decay = 12; // The weight decay.
// regularization types supported: L1 and L2
// controlled by weight_decay
optional string regularization_type = 29 [default = "L2"];
// the stepsize for learning rate policy "step"
optional int32 stepsize = 13;
// the stepsize for learning rate policy "multistep"
repeated int32 stepvalue = 34;
// Set clip_gradients to >= 0 to clip parameter gradients to that L2 norm,
// whenever their actual L2 norm is larger.
optional float clip_gradients = 35 [default = -1];
optional int32 snapshot = 14 [default = 0]; // The snapshot interval
optional string snapshot_prefix = 15; // The prefix for the snapshot.
// whether to snapshot diff in the results or not. Snapshotting diff will help
// debugging but the final protocol buffer size will be much larger.
optional bool snapshot_diff = 16 [default = false];
enum SnapshotFormat {
HDF5 = 0;
BINARYPROTO = 1;
}
optional SnapshotFormat snapshot_format = 37 [default = BINARYPROTO];
// the mode solver will use: 0 for CPU and 1 for GPU. Use GPU in default.
enum SolverMode {
CPU = 0;
GPU = 1;
}
optional SolverMode solver_mode = 17 [default = GPU];
// the device_id will that be used in GPU mode. Use device_id = 0 in default.
optional int32 device_id = 18 [default = 0];
// If non-negative, the seed with which the Solver will initialize the Caffe
// random number generator -- useful for reproducible results. Otherwise,
// (and by default) initialize using a seed derived from the system clock.
optional int64 random_seed = 20 [default = -1];
// type of the solver
optional string type = 40 [default = "SGD"];
// numerical stability for RMSProp, AdaGrad and AdaDelta and Adam
optional float delta = 31 [default = 1e-8];
// parameters for the Adam solver
optional float momentum2 = 39 [default = 0.999];
// RMSProp decay value
// MeanSquare(t) = rms_decay*MeanSquare(t-1) + (1-rms_decay)*SquareGradient(t)
optional float rms_decay = 38;
// If true, print information about the state of the net that may help with
// debugging learning problems.
optional bool debug_info = 23 [default = false];
// If false, don't save a snapshot after training finishes.
optional bool snapshot_after_train = 28 [default = true];
// DEPRECATED: old solver enum types, use string instead
enum SolverType {
SGD = 0;
NESTEROV = 1;
ADAGRAD = 2;
RMSPROP = 3;
ADADELTA = 4;
ADAM = 5;
}
// DEPRECATED: use type instead of solver_type
optional SolverType solver_type = 30 [default = SGD];
}
caffe.proto.caffe_pb2.SolverState类
244 // A message that stores the solver snapshots
245 message SolverState {
246 optional int32 iter = 1; // The current iteration
247 optional string learned_net = 2; // The file that stores the learned net.
248 repeated BlobProto history = 3; // The history for sgd solvers
249 optional int32 current_step = 4 [default = 0]; // The current step for learning rate
250 }
总之，感受到了protobuf这个出自google的包的强大和可怕。