在配置测试环境时，将生产服务器的Tomcat目录打包过来后解压后，启动Tomcat后，发现如下问题：

[tomcat@gsp bin]$ ./shutdown.sh
Using CATALINA_BASE:   /usr/local/tomcat
Using CATALINA_HOME:   /usr/local/tomcat
Using CATALINA_TMPDIR: /usr/local/tomcat/temp
Using JRE_HOME:       /usr/java/jdk1.6.0_12
/usr/local/tomcat/bin/catalina.sh: line 315: /usr/java/jdk1.6.0_12/bin/java: No such file or directory

[tomcat@gsp bin]$ ./startup.sh
Using CATALINA_BASE:   /usr/local/tomcat
Using CATALINA_HOME:   /usr/local/tomcat
Using CATALINA_TMPDIR: /usr/local/tomcat/temp
Using JRE_HOME:       /usr/java/jdk1.6.0_12

[tomcat@gsp bin]$ cd /usr/java/jdk1.6.0_12
-bash: cd: /usr/java/jdk1.6.0_12: No such file or directory

因为在测试环境，安装的是jdk-6u31-linux-x64-rpm.bin，其实并没有所谓的/usr/java/jdk1.6.0_12目录，而是/usr/java/jdk1.6.0_31
[tomcat@CEG-eSCM jdk1.6.0_31]$ pwd
/usr/java/jdk1.6.0_31

于是修改了.bash_profile  
[tomcat@gsp ~]$ more .bash_profile
# .bash_profile

# Get the aliases and functions
if [ -f ~/.bashrc ]; then
        . ~/.bashrc
fi

# User specific environment and startup programs
JAVA_HOME=/usr/java/jdk1.6.0_31/
PATH=$PATH:$HOME/bin:$JAVA_HOME/bin
export JAVA_HOME

PATH=$PATH:$HOME/bin

export PATH

但是当时忘了使用source .bash_profile 使配置信息生效，结果依然报这个错误，搜索了一下可以通过修改setclasspath.sh文件，在里面添加下面变量解决问题。如下所示

export JAVA_HOME=......
export JRE_HOME=.......

其实只要使.bash_profile配置文件生效了后，就可以将setclasspath.sh下的JAVA_HOME去掉了。在这个配置文件指定JAVA_HOME或JRE_HOME主要用于当服务器有多个版本的JDK时，指定tomcat使用某个特殊版本.

参考资料：
    http://blog.csdn.net/eifjgoergfgrgr/article/details/7556882