LINQ to SQL由C#团队开发并在.NET Framework 3.5中发布，而Entity Framework由ADO.NET团队开发并作为.NET Framework 3.5 Service Pack 1的一部分发布。此后，LINQ to SQL由ADO.NET团队接手，其结果是：在.NET 4.0中，ADO.NET团队更加专注于EF的改进，相对来说，LINQ to SQL的改进要小得多。
LINQ to SQL和Entity Framework各有所长，LINQ to SQL是一个轻量级的ORM框架，旨在为Microsoft SQL Server数据库提供快速的应用程序开发，其优点是易于使用、简单、高性能。而Entity Framework的优点在于：其为创建数据库架构和实体类之间的映射提供了更好的灵活性，它还通过提供程序支持除了SQL Server之外的第三方数据库。
EF 4.0一个非常受欢迎的改进是它现在支持与LINQ to SQL几乎同样的查询功能。这意味着我们在系列文章中的LINQ-to-db查询可以同时适用于EF 4.0和L2S。而且，这也使得L2S成为我们学习使用LINQ查询数据库的理想技术，因为其保持了对象关系方面的简单性，并且我们学习到的查询原则和技术同样适用于EF。
说明：.NET 3.5下建议使用LINQ，该版本已经完全支持成熟的LINQ；使用EF则建议使用.NET 4.0（VS2010）以上的版本，该版本有成熟完整的EF
复杂度：支持越多的特性就会越复杂。LINQ to SQL所支持的特性比较少，所以也就相对不太复杂；而EntityFramework支持的特性比较多，所以相对比较复杂。
模型：LINQ to SQL在数据表与类之间提供了一对一的映射。如果你有Customers,Orders, 和Lineitems表，你就会有Customer,Order, 和Lineitem类来匹配每一个表。EntityFramework可以使你有一个Customer类，而这个类可以匹配多个表。这就意味着公司名可以 在一个表中，但是地址是在另一个表中，而电话号码又在另一个表中，等等。
数据库服务器：LINQ to SQL只支持Microsoft SQL Server 2000及之后的版本，但即使是SQLServer2000也有很多限制。EntityFramework可以支持IBMDB2, Sybase SqlAnywhere, Oracle, SQLAzure，还有其他很多。
开发时间：LINQ to SQL很容易学，开发起来也很快，但是LINQ to SQL有一些限制，在开发较复杂的应用时可能会产生问题。EntityFramework的能力更强，虽然学习及应用起来比较慢，但是对更多的特性的支持使得在开发较复杂的应用时可以使问题最小化。
继承：LINQ to SQL支持TPH，而EntityFramework支持TPH和TPT，并且对TPC也部分支持。
文件类型：LINQ to SQL使用包含XML的数据库标记语言(DBML)文件来映射entity与数据表。EntityFramework 使用四个文件。第一个是Entity Data Model (EDMX)，这个是在设计器中使用的。在编译时EDMX文件产生了其他三个文件。另外三个文件中，第一个是ConceptualSchema Definition Language(CSDL)文件，其包含概念模型的XML定义。第二个是SchemaDefinition Language(SSDL)文件，其包含存储模型的定义。第三个文件是Mapping Specification Language(MSL)文件，其包含概念模型与存储模型之间的映射。
复杂类型支持：比如说，一个客户有电话号码，但你想要电话号码定义为国家区号，地区号，城市区号，号码和分机号。LINQto SQL不支持这种复杂类型，而EntityFramework支持。
查询能力：LINQ to SQL通过DataContext对数据库进行查询。EntityFramework通过ObjectContext通过LINQto Entities进行查询。Entity Framework还提供了ESQL，它是一种类似SQL的查询语言，很适合在模型定义中定义查询。EntityFramework还包含了 ObjectQuery类，用于对象服务在运行时动态创建查询。最后EntityFramework还包含EntityClientProvider，它 用于对概念模型进行查询。
性能：LINQ to SQL和Entity Framework第一次执行查询的时候都比较慢，但之后性能都让人比较满意。EntityFramework性能要稍微优于LINQto SQL。
完善：微软在发布了Entity Framework之后就停止了发布新的LINQ to SQL，但由于LINQto SQL的简单性，它还是很受欢迎的，所以微软仍将继续对LINQto SQL的用户进行支持与反馈，但是LINQto SQL将不再发布新版本进行完善。
由模型生成数据库：LINQ to SQL没有能力由模型生成数据库。Entity Framework支持两种类型的开发模式，数据库优先和编码优先。数据库优先开发，数据库已经存在，所以不需要由模型生成数据库。编码优先，你要先创建你的模型，然后由模型生成数据库。