DNA序列

DNA序列

描述
一个 DNA 序列由 A/C/G/T 四个字母的排列组合组成。 G 和 C 的比例(定义为 GC-Ratio )是序列中 G 和 C 两个字母的总的出现次数除以总的字母数目(也就是序列长度)。在基因工程中,这个比例非常重要。因为高的 GC-Ratio 可能是基因的起始点。

给定一个很长的 DNA 序列,以及限定的子串长度 N ,请帮助研究人员在给出的 DNA 序列中从左往右找出 GC-Ratio 最高且长度为 N 的第一个子串。
DNA序列为 ACGT 的子串有: ACG , CG , CGT 等等,但是没有 AGT , CT 等等

数据范围:字符串长度满足 1<=n<=1000 ,输入的字符串只包含 A/C/G/T 字母
输入描述:
输入一个string型基因序列,和int型子串的长度

输出描述:
找出GC比例最高的子串,如果有多个则输出第一个的子串

示例1
输入:
ACGT
2

输出:
CG

说明:
ACGT长度为2的子串有AC,CG,GT3个,其中AC和GT2个的GC-Ratio都为0.5,CG为1,故输出CG
示例2
输入:
AACTGTGCACGACCTGA
5

输出:
GCACG

说明:
虽然CGACC的GC-Ratio也是最高,但它是从左往右找到的GC-Ratio最高的第2个子串,所以只能输出GCACG。

滑动窗口

#include<iostream>
#include<string>
using namespace std;

int main(){
    string str;
    int N;
    while(cin>>str>>N){
        string ans="";
        int maxnum=0;
        for(int i=0;i<str.size()-N+1;++i){
            int cnt=0;
            for(int j=i;j<i+N;++j){
                if(str[j]=='C' || str[j]=='G') cnt++;
            }
            if(cnt>maxnum){
                maxnum=cnt;
                ans=str.substr(i,N);
            }
        }
        cout<<ans<<endl;
    }
    return 0;
}
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