利用phytree对象的方法创建一个进化树的基本框架,其中图元素都是静态的。
tr=phytreeread(‘pf00002.tree’);
plot(tr)
将Phytree对象信息导入Biograph对象,以便创建一个动态框架,首先,从PHYTREE中提取信息。利用get函数获得PHYTREE属性,利用getmatrix方法获得连接矩阵。
[names,nn,nb,n1]=get(tr,‘NodeNames’,‘NumNodes’,‘NumBranches’,‘NumLeaves’);
cm=getmatrix(tr);
cm=flipud(fliplr(cm));
names=flipud(names);
bg=biograph(cm,names)
dolayout(bg)
bgInViewer=view(bg)
进化树一
进化树二
进化树三
分支节点的颜色
生物信息学分析与实践------MATLAB生物信息学工具箱应用----刘伟、孙志强、杨森编著-----【M】北京:中国工信出版社与电子工业出版社
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