Linux运行Java出现“Exception in thread "main" java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space”报错

2022-05-03 18:45:29

在运行如下程序时出现“Exception in thread "main" java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space”报错：

java  -jar picard.jar SortVcf \

    I=hg19.sites.vcf \

    O=hg19.sites.sorted.vcf \

 SEQUENCE_DICTIONARY=hg19.dict

　　出现这种报错说明内存不足。因此我们可以加上“-Xmx”参数

java  -Xmx60g -jar picard.jar SortVcf \

    I=hg19.sites.vcf \

    O=hg19.sites.sorted.vcf \

 SEQUENCE_DICTIONARY=hg19.dict

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