group_by()和summarize()的组合构成了使用dplyr包时最常用的操作之一：分组摘要。

summarize()，可以将数据框折叠成一行，比如我们求flights数据集中变量dep_delay的平均值：

library(dplyr)
library(nycflights13)
summarize(flights,delay=mean(dep_delay,na.rm=TRUE))

分组摘要group_by()和summarize()

如果对按日期分组的一个数据框应用与上面完全相同的代码，那么我们就可以得到每日平均延误时间：

by_day <- group_by(flights,year,month,day)
summarise(by_day,delay=mean(dep_delay,na.rm=TRUE))
# A tibble: 365 x 4
# Groups:   year, month [12]
    year month   day delay
   <int> <int> <int> <dbl>
 1  2013     1     1 11.5 
 2  2013     1     2 13.9 
 3  2013     1     3 11.0 
 4  2013     1     4  8.95
 5  2013     1     5  5.73
 6  2013     1     6  7.15
 7  2013     1     7  5.42
 8  2013     1     8  2.55
 9  2013     1     9  2.28
10  2013     1    10  2.84
# ... with 355 more rows

使用管道组合多种操作

library(ggplot2)
by_dest <- group_by(flights,dest)
delay <- summarise(by_dest,count=n(),dist=mean(distance,na.rm = TRUE),delay=mean(arr_delay,na.rm = TRUE))
delay <- filter(delay,count>20,dest!='HNL')
ggplot(delay,aes(dist,delay))+geom_point(aes(size=count),alpha=1/3)+geom_smooth(se=FALSE)

image.png
为了增加代码的可读性，可以将上面的中间变量省去，使用管道符号%>%来传递，%>%符号可以读作“然后”。

delays <- flights %>% group_by(dest) %>% summarise(count=n(),dist=mean(distance,na.rm = TRUE),delay=mean(arr_delay,na.rm = TRUE)) %>% filter(count >20 ,dest!='HNL')
ggplot(delays,aes(dist,delay))+geom_point(aes(size=count),alpha=1/3)+geom_smooth(se=FALSE)

缺失值

在前面的代码中我们使用了参数na.rm，如果不使用会发生什么？效果如下:

flights %>% group_by(year,month,day) %>% summarise(mean=(mean(dep_delay)))
# A tibble: 365 x 4
# Groups:   year, month [12]
    year month   day  mean
   <int> <int> <int> <dbl>
 1  2013     1     1    NA
 2  2013     1     2    NA
 3  2013     1     3    NA
 4  2013     1     4    NA
 5  2013     1     5    NA
 6  2013     1     6    NA
 7  2013     1     7    NA
 8  2013     1     8    NA
 9  2013     1     9    NA
10  2013     1    10    NA
# ... with 355 more rows

这时会得到很多缺失值，这是因为聚合函数遵循一般的缺失规则：如果输入中有缺失值，那么输出也会是缺失值，而使用na.rm=TRUE可以在计算前去除缺失值。
当然，也可以通过去除取消的航班以剔除缺失值：

not_cancelled <- flights %>% filter(!is.na(dep_delay),!is.na(arr_delay))
not_cancelled %>% group_by(year,month,day) %>% summarize(mean=mean(dep_delay))
# A tibble: 365 x 4
# Groups:   year, month [12]
    year month   day  mean
   <int> <int> <int> <dbl>
 1  2013     1     1 11.4 
 2  2013     1     2 13.7 
 3  2013     1     3 10.9 
 4  2013     1     4  8.97
 5  2013     1     5  5.73
 6  2013     1     6  7.15
 7  2013     1     7  5.42
 8  2013     1     8  2.56
 9  2013     1     9  2.30
10  2013     1    10  2.84
# ... with 355 more rows

计数
聚合操作中包括一个计数(n())或非缺失值计数(sum(!is.na()))是个好主意。这样就可以检查是不是基于非常少的数据做出结论。例如，查看具有最长平均延误时间的飞机：

delays <- not_cancelled %>% group_by(tailnum) %>% summarise(delay=mean(arr_delay))
ggplot(delays,aes(delay))+geom_freqpoly(binwidth = 10)

image.png

绘制航班数量和平均延误时间的散点图可以获得更深刻的理解：

delays <- not_cancelled %>% group_by(tailnum) %>% summarise(delay=mean(arr_delay,na.rm = TRUE),n=n())
ggplot(delays,aes(n,delay))+geom_point(alpha=1/3)

image.png

结果显示，航班数量非常少时，平均延误时间变动特别大。
将ggplot2集成到dplyr工作流中：

delays %>% filter(n >25) %>% ggplot(aes(n,delay))+geom_point(alpha=1/10)

image.png

常用摘要函数

位置度量
mean(x),median(x),均值和中位数
分散程度度量
sd(x),IQR(x),mad(x)，标准误差，四分位距，绝对中位差
秩的度量
min(x),quantile(x,0.25),max(x)
quantile(x,0.25)会找出顺序大于25%而小于后75%的值。
定位度量
first(x),nth(x,2),last(x)
上面函数的作用与x[1],x[2]和x[length(x)]相同。
计数
n(x),sum(!is.na(x))
n_distinct(x)计算唯一值的数量
逻辑值的计数和比例
sum(x >10 )和mean(y == 0)
sum(x)可以找出x中TRUE的数量，mean(x)则可以找出比例。