1.安装cmake
sudo apt install cmake
输入以下命令,出现版本号即安装成功。
cmake --version
ccmake会遇到的问题,在这里先安装了。
sudo apt install cmake-curses-gui
2.安装git
sudo apt install git
3.安装c++编译器
3.
git clone https://github.com/ANTsX/ANTs.git mkdir build install cd build ccmake ../ANTs
出现GUI后,按一下c,
em,遇到问题
tar zvfx zlib-1.2.11.tar.gz cd zlib-1.2.11 ./configure make make check sudo make install
重做ccmake这一步,按c,按g回到命令行。
4.
编译
make -j 2 2>&1 | tee build.log
一直卡在cloning into那里,我都以为不会继续下去了,放了一晚上,早上到实验室一看,结束了
5.
cd ANTS-build make install 2>&1 | tee install.log
这一步注意要root权限,不然创建不了bin文件夹。
6.配置环境变量
export ANTSPATH=/opt/ANTs/bin/ export PATH=${ANTSPATH}:$PATH
如果只做上面这步的话,每次都要输入这两句。
所以,如下:
vim ~/.bashrc export ANTSPATH=/opt/ANTs/bin/ export PATH=${ANTSPATH}:$PATH
7.使用
antsRegistrationSyN.sh