Ubuntu虚拟机安装ANTs

1.安装cmake

 sudo apt install cmake 

输入以下命令,出现版本号即安装成功。

 cmake --version 

ccmake会遇到的问题,在这里先安装了。

 sudo apt install cmake-curses-gui 

2.安装git

 sudo apt install git 

3.安装c++编译器

 

3.

git clone https://github.com/ANTsX/ANTs.git
mkdir build install
cd build
ccmake ../ANTs

出现GUI后,按一下c,

em,遇到问题

Ubuntu虚拟机安装ANTs

 

 http://www.zlib.net/

tar zvfx zlib-1.2.11.tar.gz
cd zlib-1.2.11
./configure
make 
make check
sudo make install

重做ccmake这一步,按c,按g回到命令行。

4.

编译

 make -j 2 2>&1 | tee build.log 

一直卡在cloning into那里,我都以为不会继续下去了,放了一晚上,早上到实验室一看,结束了

Ubuntu虚拟机安装ANTs

 

 5.

cd ANTS-build
make install 2>&1 | tee install.log

这一步注意要root权限,不然创建不了bin文件夹。

6.配置环境变量

export ANTSPATH=/opt/ANTs/bin/
export PATH=${ANTSPATH}:$PATH

  如果只做上面这步的话,每次都要输入这两句。

所以,如下:

vim ~/.bashrc
export ANTSPATH=/opt/ANTs/bin/
export PATH=${ANTSPATH}:$PATH

7.使用

antsRegistrationSyN.sh

 

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