机器学习——PCA(主成分分析)

 主成分分析(Principal components analysis,以下简称PCA)是最常用的降维方法之一,在数据压缩和消除冗余方面具有广泛的应用,本文由浅入深的对其降维原理进行了详细总结。

1. 向量投影和矩阵投影的含义

如下图:

机器学习——PCA(主成分分析)

向量a在向量b的投影为:

机器学习——PCA(主成分分析)

其中,θ是向量间的夹角 。

向量a在向量b的投影表示向量a在向量b方向的信息,若θ=90°时,向量a与向量b正交,向量a无向量b信息,即向量间无冗余信息 。因此,向量最简单的表示方法是用基向量表示,如下图:

机器学习——PCA(主成分分析)

 

向量表示方法:

机器学习——PCA(主成分分析)

其中,c1是机器学习——PCA(主成分分析)在e1方向的投影,c2是机器学习——PCA(主成分分析)在e2方向的投影,e1和e2是基向量

 

我们用向量的表示方法扩展到矩阵,若矩阵机器学习——PCA(主成分分析)

,其中ai(i=1,2,...,n)为n个维度的列向量,那么矩阵A的列向量表示为:

机器学习——PCA(主成分分析)

其中,e1,e2,...,en为矩阵A的特征向量 。

若矩阵A是对称矩阵,那么特征向量为正交向量,我们对上式结合成矩阵的形式:

机器学习——PCA(主成分分析)

 

机器学习——PCA(主成分分析)

 

由上式可知,对称矩阵A在各特征向量的投影等于矩阵列向量展开后的系数,特征向量可理解为基向量。

2. 向量降维和矩阵降维含义

向量降维可以通过投影的方式实现,N维向量映射为M维向量转换为N维向量在M个基向量的投影,如N维向量机器学习——PCA(主成分分析)在基向量的投影:

机器学习——PCA(主成分分析)

通过上式完成了降维,降维后的坐标为:

机器学习——PCA(主成分分析)

矩阵是由多个列向量组成的,因此矩阵降维思想与向量降维思想一样,只要求得矩阵在各基向量的投影即可,基向量可以理解为新的坐标系,投影就是降维后的坐标,那么问题来了,如何选择基向量?

 

3. 基向量选择算法

已知样本集的分布,如下图:

机器学习——PCA(主成分分析)

样本集共有两个特征x1和x2,现在对该样本数据从二维降到一维,图中列了两个基向量u1和u2,样本集在两个向量的投影表示了不同的降维方法,哪种方法好,需要有评判标准:(1)降维前后样本点的总距离足够近,即最小投影距离;(2)降维后的样本点(投影)尽可能的散开,即最大投影方差 。因此,根据上面两个评判标准可知选择基向量u1较好。

 

我们知道了基向量的选择标准,下面介绍基于这两个评判标准来推导基向量:

(1)基于最小投影距离

假设有n个n维数据机器学习——PCA(主成分分析),记为X。现在对该数据从n维降到m维,关键是找到m个基向量,假设基向量为{w1,w2,...,wm},记为矩阵W,矩阵W的大小是n×m。

原始数据在基向量的投影:机器学习——PCA(主成分分析)

投影坐标计算公式:

机器学习——PCA(主成分分析)

根据投影坐标和基向量,得到该样本的映射点:

机器学习——PCA(主成分分析)

最小化样本和映射点的总距离:

机器学习——PCA(主成分分析)

推导上式,得到最小值对应的基向量矩阵W,推导过程如下:

机器学习——PCA(主成分分析)

机器学习——PCA(主成分分析)

机器学习——PCA(主成分分析)

机器学习——PCA(主成分分析)

机器学习——PCA(主成分分析)

机器学习——PCA(主成分分析)

所以我们选择机器学习——PCA(主成分分析)的特征向量作为投影的基向量 。

(2) 基于最大投影方差

我们希望降维后的样本点尽可能分散,方差可以表示这种分散程度。

机器学习——PCA(主成分分析)

如上图所示,机器学习——PCA(主成分分析)表示投影数据的平均值。所以最大化投影方差表示为:

机器学习——PCA(主成分分析)

下面推导上式,得到相应的基向量矩阵W,推导过程如下:

机器学习——PCA(主成分分析)

机器学习——PCA(主成分分析)

我们发现(4)式与上一节的(13)式是相同的。

因此,基向量矩阵W满足下式:

机器学习——PCA(主成分分析)

小结:降维通过样本数据投影到基向量实现的,基向量的个数等于降维的个数,基向量是通过上式求解的。

4. 基向量个数的确定

我们知道怎么求解基向量,但是我们事先确定了基向量的个数,如上节的m个基向量,那么怎么根据样本数据自动的选择基向量的个数了?在回答这一问题前,简单阐述下特征向量和特征值的意义。

假设向量wi,λi分别为机器学习——PCA(主成分分析)的特征向量和特征值,表达式如下:

机器学习——PCA(主成分分析)

对应的图:

机器学习——PCA(主成分分析)

由上图可知,机器学习——PCA(主成分分析)没有改变特征向量wi的方向,只在wi的方向上伸缩或压缩了λi倍。特征值代表了机器学习——PCA(主成分分析)在该特征向量的信息分量。特征值越大,包含矩阵机器学习——PCA(主成分分析)的信息分量亦越大。因此,我们可以用λi去选择基向量个数。我们设定一个阈值threshold,该阈值表示降维后的数据保留原始数据的信息量,假设降维后的特征个数为m,降维前的特征个数为n,m应满足下面条件:

机器学习——PCA(主成分分析)

因此,通过上式可以求得基向量的个数m,即取前m个最大特征值对应的基向量 。

投影的基向量:

机器学习——PCA(主成分分析)

投影的数据集:

机器学习——PCA(主成分分析)

5. 中心化的作用

我们在计算协方差矩阵机器学习——PCA(主成分分析)的特征向量前,需要对样本数据进行中心化,中心化的算法如下:

机器学习——PCA(主成分分析)

中心化数据各特征的平均值为0,计算过程如下:

对上式求平均:

机器学习——PCA(主成分分析)

中心化的目的是简化算法,我们重新回顾下协方差矩阵,以说明中心化的作用 。

机器学习——PCA(主成分分析),X表示共有n个样本数。

每个样本包含n个特征,即:

机器学习——PCA(主成分分析)

展开机器学习——PCA(主成分分析):

机器学习——PCA(主成分分析)

 

为了阅读方便,我们只考虑两个特征的协方差矩阵:

机器学习——PCA(主成分分析)

由(3)式推导(2)式得:

机器学习——PCA(主成分分析)

所以机器学习——PCA(主成分分析)是样本数据的协方差矩阵,但是,切记必须事先对数据进行中心化处理 。

6. PCA算法流程

1)样本数据中心化。

2)计算样本的协方差矩阵机器学习——PCA(主成分分析)

3)求协方差矩阵机器学习——PCA(主成分分析)的特征值和特征向量,并对该向量进行标准化(基向量)。

3)根据设定的阈值,求满足以下条件的降维数m。

机器学习——PCA(主成分分析)

4)取前m个最大特征值对应的向量,记为W。

机器学习——PCA(主成分分析)

5)对样本集的每一个样本机器学习——PCA(主成分分析)

机器学习——PCA(主成分分析)

6)得到映射后的样本集D'。

机器学习——PCA(主成分分析)

7. 核主成分分析(KPCA)介绍

因为机器学习——PCA(主成分分析)可以用样本数据内积表示:

机器学习——PCA(主成分分析)

由核函数定义可知,可通过核函数将数据映射成高维数据,并对该高维数据进行降维:

机器学习——PCA(主成分分析)

KPCA一般用在数据不是线性的,无法直接进行PCA降维,需要通过核函数映射成高维数据,再进行PCA降维 。

8. PCA算法总结

PCA是一种非监督学习的降维算法,只需要计算样本数据的协方差矩阵就能实现降维的目的,其算法较易实现,但是降维后特征的可解释性较弱,且通过降维后信息会丢失一些,可能对后续的处理有重要影响。

参考

https://www.cnblogs.com/pinard/p/6239403.html#undefined

A Singularly Valuable Decompostion: The SVD of a Matrix

 9.PCA python调用

import pandas as pd
import scipy.io as scio
import matplotlib.pyplot as plt
#加载matplotlib用于数据的可视化
from sklearn.decomposition import PCA
#加载PCA算法包

data_n = scio.loadmat('../课件与相关资料/PCA/negative.mat')
data_p = scio.loadmat('../课件与相关资料/PCA/positive.mat')

data_n = pd.DataFrame(data_n['MITforest'])
data_p = pd.DataFrame(data_p['bedroom'])

data = pd.concat([data_n,data_p],axis=0)
label = [0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,0,
         1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1,1]

pca = PCA(n_components=2)
# 加载PCA算法,设置降维后主成分数目为2

reduced_X = pca.fit_transform(data)
# 对原始数据进行降维,保存在reduced_X中

n_x, n_y = [], []
p_x, p_y = [], []

for i in range(len(reduced_X)):
    if label[i] == 0:
        n_x.append(reduced_X[i][0])
        n_y.append(reduced_X[i][1])
    else:
        p_x.append(reduced_X[i][0])
        p_y.append(reduced_X[i][1])
#分组,添加数据


plt.scatter(p_x, p_y, c='r', marker='x')
plt.scatter(n_x, n_y, c='b', marker='D')
plt.show()
#绘图

机器学习——PCA(主成分分析)

 

 

转载于:https://mp.weixin.qq.com/s/AlHHCE5HrWdjVs3ggkTWsQ

 

   
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