CNS级别的高级气泡图——R语言简单实现

气泡图大家平时比较常见,其实就是将数值大小映射到气泡的大小上,使用R语言做气泡图非常的简单,今天我们教大家来学习一下气泡图的R语言画法。

教程讲解

1.加载需要的R包

library(openxlsx)
library(tidyverse)

2.数据介绍,就是一般的GO富集分析结果,每一列代表一种类型的数据

  • Category包括三个变量,分别是BP,CC,MF,接触过组学的同学都懂

  • GOID就是GO术语的ID

  • 其他列看第一列就明白意思了

3.读取数据

data <- read.xlsx("GO_气泡图.xlsx")

4.使用ggplot2进行作图

  • 将Category映射到shape,用不同的形状表示不同的生物过程

  • 将padj映射到colour

  • 将Count映射到size,更加明显看到节点的大小

ggplot(data,aes(Count,Description,
               shape=Category,
               colour=padj,
               size=Count))+
 geom_point()

CNS级别的高级气泡图——R语言简单实现

5.进一步的对图形进行美化

  • 使用windo

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