phpDocuemtor官网：http://www.phpdoc.org/
通过pear安装，进入dos的php目录，输入pear install -a PhpDocumentor。如果想使用web接口，则必须首先改变一个配置，参考：http://developer.51cto.com/art/200912/166582.htm。
终端：phpdoc -h 可以查看所有的指令，选几个重要的：
-d 源php文件的路径
-t 生成文档后文档的存放路径（最好为其单独创建一个文件夹）
-dn 包的名字（默认为default，最好改成项目的名字）
-dc 目录的名字（默认为default，最好改成项目的名字）
-ti 文档标题 这是首页上的大标题
-o 生成的文档的模板格式，这个应该有很多种可以选择，不过我只选择：HTML:Smarty:PHP（感觉比较美观）
phpDocumentor的安装很简单,
如果通过pear自动安装
在命令行下输入 pear install
PhpDocumentor
如果是手动安装
则在http://manual.phpdoc.org/下载最新版本的PhpDocumentor（现在是1.4.2），把内容解压即可.
phpdocumentor的使用也很简单, 分为命令行模式和web模式:
命令行模式
在phpDocumentor所在目录下，输入
php –h
会得到一个详细的参数表，其中几个重要的参数如下：
-f
要进行分析的文件名，多个文件用逗号隔开
-d 要分析的目录，多个目录用逗号分割
-t 生成的文档的存放路径
-o
输出的文档格式，结构为输出格式：转换器名：模板目录。
例如：phpdoc -o HTML:frames:earthli -f test.php -t
docs
Web模式
在新的phpdoc中，除了在命令行下生成文档外，还可以在客户端浏览器上操作生成文档，具体方法是先把PhpDocumentor的内容放在
apache目录下使得通过浏览器可以访问到
点击files按钮，选择要处理的php文件或文件夹，还可以通过该指定该界面下的Files to
ignore来忽略对某些文件的处理。
然后点击output按钮来选择生成文档的存放路径和格式.
最后点击create，phpdocumentor就会自动开始生成文档了，最下方会显示生成的进度及状态，如果成功，我们就可以通过查看生成的文档了，如果是pdf格式的，名字默认为documentation.pdf。