MongoDB是一个基于分布式文件存储的数据库。由C++语言编写。旨在为WEB应用提供可扩展的高性能数据存储解决方案。
HBase是一个分布式的、面向列的开源数据库，该技术来源于 Fay Chang 所撰写的Google论文“Bigtable：一个结构化数据的分布式存储系统”。
两者的区别主要在于：
1、HBase依赖于HDFS；MongoDB直接存储在本地磁盘中
2、HBase按照列族将数据存储在不同的文件中；MongoDB不分列，整个文档都存储在一个（或者说一组）文件中，通过一个有一个通用的.ns文件保存名称空间（Column-based和Document-Based之间的区别应该是指这个地方吧）
3、HBase一个region只有一个HRegionServer对外提供服务（没有负载均衡的概念）；MongoDB的shards（类似于region）支持负载均衡（主从结构，通过日志进行同步，这个HBase也在开发计划当中）
4、HBase根据文件的大小来控制region的分裂；MongoDB根据负载来决定shards的分裂（没有深入研究,不知道如何根据负载的）。
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