图神经网络学习-task01简单图论与环境配置

一、图论基础知识

  • 连通图

 图神经网络学习-task01简单图论与环境配置

二、拉普拉斯矩阵

拉普拉斯矩阵(Laplacian matrix) 也叫做导纳矩阵、基尔霍夫矩阵或离散拉普拉斯算子,主要应用在图论中,作为一个图的矩阵表示。

定义

图神经网络学习-task01简单图论与环境配置

度矩阵

邻接矩阵

拉普拉斯矩阵

图神经网络学习-task01简单图论与环境配置

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三、配置

极客云:https://www.jikecloud.net/login.html

图神经网络学习-task01简单图论与环境配置

1、修改torch版本

pip install update torch==1.8.1

pip uninstall torch

pip uninstall torchvision

pip install torchvision

#使用的cudatoolkit 为10.1

2. 安装正确版本的PyG

pip install torch-scatter -f https://pytorch-geometric.com/whl/torch-1.8.0+cu101.html

pip install torch-sparse -f https://pytorch-geometric.com/whl/torch-1.8.0+cu101.html

pip install torch-cluster -f https://pytorch-geometric.com/whl/torch-1.8.0+cu101.html

pip install torch-spline-conv -f https://pytorch-geometric.com/whl/torch-1.8.0+cu101.html

pip install torch-geometric

 

四、Dataset类——PyG中图数据集的表示及其使用

PyG内置了大量常用的基准数据集,接下来我们以PyG内置的 Planetoid 数据集为例,来学习PyG中图数据集的表示及使用。

Planetoid 数据集类的官方文档为torch_geometric.datasets.Planetoid。

生成数据集对象并分析数据集如下方代码所示,在PyG中生成一个数据集是简单直接的。在第一次生成PyG内置的数据集时,程序首先下载原始文件,然后将原始文件处理成包

含 Data 对象的 Dataset 对象并保存到文件。

 

注意:

读取数据集报错时,有3种处理办法:

https://blog.csdn.net/PolarisRisingWar/article/details/116399648

 

其中一种:

https://github.com/kimiyoung/planetoid/raw/master/data/ind.cora.从这里把数据下载下来,上传到相应目录里

第二种:利用request下载,推荐第一种,比较块

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