重置root密码的方法：

windows系统下：
1、停止mysql服务；
2、新建文件init-root.txt,写上如下内容：
update mysql.user set password = password('newpwd') where user = 'root';
flush privileges;
保存；
3、打开命令行，输入：C:\mysql\bin\mysqld --init-file=C:\\mysql-init.txt
--init-file 选项指向初始化的文件

如果MySQL是通过GUI界面安装向导安装的话，如下：
C:\> "C:\Program Files\MySQL\MySQL Server 5.6\bin\mysqld.exe"
--defaults-file="C:\\Program Files\\MySQL\\MySQL Server 5.6\\my.ini"
--init-file=C:\\mysql-init.txt
--defaults-file 选项指向mysql的配置文件

4、服务重启后密码已经重置，可以删掉init-root.txt文件。

linux下，第一种方法类似windows中：
1、停止mysql服务（kill掉进程）；
2、新建文件init-root,写上如下内容：
update mysql.user set password = password('newpwd') where user = 'root';
flush privileges;
保存；
3、在shell中运行： mysqld_safe --init-file=/home/me/mysql-init &

4、服务重启，可以删掉init-root.txt文件。

所有平台都可用的方法：
1、停止mysqld服务，
2、配置my.conf文件，加入： --skip-grant-tables选项，跳过权限检查； --skip-networking 选项阻止远程客户网络连接；
3、重启mysqld服务，
shell> service mysqld start
4、登录client，
shell> mysql
5、更改密码：
mysql> update mysql.user set password = password('newpwd') where user='root';
mysql> flush privileges;
6、关闭mysqld服务，删除--skip-grant-tables和--skip-networking选项，重启服务即可

参考：

MySQL官方文档：
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.6/en/resetting-permissions.html