我这边测试直接合成音质有问题
分两步正常

先把音频分离出来
ffmpeg -i "audio.m4a" -acodec copy "tmp_audio.aac"

然后把原始视频和上一步得到的aac组装到一起
ffmpeg -i "video.mp4" -i "tmp_audio.aac" -c copy -shortest "output.mp4"

或者 #4 提到的方法也可以，就是麻烦很多

 

https://github.com/Momo707577045/media-source-extract/issues/5