我正在尝试使用pySpark中的.saveAsTable()将Spark DataFrame保存到Hive表(Parquet)中,但仍然会遇到以下内存问题:
org.apache.hadoop.hive.ql.metadata.HiveException: parquet.hadoop.MemoryManager$1:
New Memory allocation 1034931 bytes is smaller than the minimum allocation size of 1048576 bytes.
第一个数字(1034931)通常在不同的运行中保持变化.我知道第二个数字(1048576)是1024 ^ 2,但是我不知道这是什么意思.
我在其他几个项目中使用了完全相同的技术(具有更大的DataFrame),并且该方法没有出现问题.在这里,我基本上复制粘贴了过程和配置的结构,但是遇到了内存问题!这一定是我想念的琐碎小事.
Spark DataFrame(我们称其为sdf)具有以下结构(〜10列和〜300k行,但如果运行正确,可能会更多):
+----------+----------+----------+---------------+---------------+
| col_a_str| col_b_num| col_c_num|partition_d_str|partition_e_str|
+----------+----------+----------+---------------+---------------+
|val_a1_str|val_b1_num|val_c1_num| val_d1_str| val_e1_str|
|val_a2_str|val_b2_num|val_c2_num| val_d2_str| val_e2_str|
| ...| ...| ...| ...| ...|
+----------+----------+----------+---------------+---------------+
Hive表是这样创建的:
sqlContext.sql("""
CREATE TABLE IF NOT EXISTS my_hive_table (
col_a_str string,
col_b_num double,
col_c_num double
)
PARTITIONED BY (partition_d_str string,
partition_e_str string)
STORED AS PARQUETFILE
""")
使用以下命令尝试向该表中插入数据:
sdf.write \
.mode('append') \
.partitionBy('partition_d_str', 'partition_e_str') \
.saveAsTable('my_hive_table')
Spark / Hive配置如下所示:
spark_conf = pyspark.SparkConf()
spark_conf.setAppName('my_project')
spark_conf.set('spark.executor.memory', '16g')
spark_conf.set('spark.python.worker.memory', '8g')
spark_conf.set('spark.yarn.executor.memoryOverhead', '15000')
spark_conf.set('spark.dynamicAllocation.maxExecutors', '64')
spark_conf.set('spark.executor.cores', '4')
sc = pyspark.SparkContext(conf=spark_conf)
sqlContext = pyspark.sql.HiveContext(sc)
sqlContext.setConf('hive.exec.dynamic.partition', 'true')
sqlContext.setConf('hive.exec.max.dynamic.partitions', '5000')
sqlContext.setConf('hive.exec.dynamic.partition.mode', 'nonstrict')
sqlContext.setConf('hive.exec.compress.output', 'true')
我尝试将.partitionBy(‘partition_d_str’,’partition_e_str’)更改为.partitionBy([‘partition_d_str’,’partition_e_str’])),增加内存,将DataFrame拆分为较小的块,然后重新创建表和DataFrame,但是似乎没有任何工作.我也找不到在线任何解决方案.是什么引起内存错误(我不完全了解这两个错误来自何处),以及如何更改代码以写入Hive表?谢谢.
解决方法:
事实证明,我正在使用可为空的字段进行分区,该字段使.saveAsTable()无效.当我将RDD转换为Spark DataFrame时,我提供的架构是这样生成的:
from pyspark.sql.types import *
# Define schema
my_schema = StructType(
[StructField('col_a_str', StringType(), False),
StructField('col_b_num', DoubleType(), True),
StructField('col_c_num', DoubleType(), True),
StructField('partition_d_str', StringType(), False),
StructField('partition_e_str', StringType(), True)])
# Convert RDD to Spark DataFrame
sdf = sqlContext.createDataFrame(my_rdd, schema=my_schema)
由于partition_e_str被声明为nullable = True(该StructField的第三个参数),因此在写入Hive表时会遇到问题,因为它被用作分区字段之一.我将其更改为:
# Define schema
my_schema = StructType(
[StructField('col_a_str', StringType(), False),
StructField('col_b_num', DoubleType(), True),
StructField('col_c_num', DoubleType(), True),
StructField('partition_d_str', StringType(), False),
StructField('partition_e_str', StringType(), False)])
一切都恢复了!
课程:确保分区字段不可为空!