数据挖掘1:K-means均值聚类算法

  一.K-means均值聚类算法原理

  对于给定的样本集,按照样本之间的距离大小,将样本集划分为K个簇。让簇内的点尽量紧密的连在一起,而让簇间的距离尽量的大。

  如果用数据表达式表示,假设簇划分为(C1,C2,…Ck),则我们的目标是最小化平方误差E:

  

数据挖掘1:K-means均值聚类算法

 

  其中μi是簇Ci的均值向量,有时也称为质心,表达式为:

  

数据挖掘1:K-means均值聚类算法

 

  二.K-means均值聚类算法步骤:

  数据样本间的相似性度量:欧式距离

  评价聚类性能的准则函数:最小误差准则函数

  输入:簇的数目k和包含n个对象的数据库

  输出:k个簇,使平方误差准则最小

  设置初始类别中心和簇数

  根据簇中心对数据进行簇划分

  重新计算当前簇划分下每个簇的中心

  在得到簇中心下继续进行簇划分

  如果连续两次的簇划分结果不变(即最小误差函数的值达到最优)则停止算法;否则一直循环

  实验源码:

  # 导入第三方模块

  import random

  import numpy as np

  import pandas as pd

  from matplotlib import pyplot as plt

  from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D # 空间三维画图

  def load_data(path):

  df = pd.read_excel(path)

  column_count = df.shape[1]

  df_li = df.values.tolist()

  return df_li,column_count

  # 计算欧式距离,并且存储到数组中

  def distance(dataSet,centroids,k):

  '''

  利用np.tile()将dataSet中的元素扩展到与centroids同一个shape

  也就是算出dataSet中的每一个元素分别与centroids的disatcne,

  存储到一个列表中,并将这个列表存储到原先设定的空列表中,最后

  将存储完数据的列表转换为数组格式

  需要明确的是,分成几簇,必定会有k个质心,扩展成k维后,能分别

  计算数据集中的某一个元素与这k个质心的距离

  '''

  dis_list = []

  for data in dataSet:

  diff = (np.tile(data,(k,1)))-centroids

  squaredDiff = diff ** 2

  squaredDist = np.sum(squaredDiff,axis=1)

  distance = squaredDist ** 0.5

  dis_list.append(distance)

  dis_list = np.array(dis_list)

  return dis_list

  # 计算质心,并且返回质心变化量

  def Centroids_Init(dataSet,centroids,k):

  # 首先计算初始化质心与数据集元素之间的距离

  dis_list = distance(dataSet,centroids,k)

  # 根据第一次距离计算进行分类,并计算出新的质心

  minDistIndices = np.argmin(dis_list,axis=1) #axis 表示每行最小值下标

  # #DataFrame(dataSet)对DataSet分组

  # groupby(min)按照min进行统计分类

  # mean()对分类结果求均值

  newCentroids = pd.DataFrame(dataSet).groupby(minDistIndices).mean()

  newCentroids = newCentroids.values

  # 计算新质心与初始化质心的变化量

  centroids_change = newCentroids - centroids

  return centroids_change,newCentroids

  # 使用K-means进行分类

  def k_means(dataSet,k):

  # 随机获取质心,作初始化处理

  # 从数据集中随机取k个元素作为质心

  centroids = random.sample(dataSet,k)

  centroids_change,newCentroids = Centroids_Init(dataSet,centroids,k)

  # 不断更新质心,直到centroids_change为0,表示聚类中心已经确定

  while np.any(centroids_change != 0 ):

  centroids_change,newCentroids = Centroids_Init(dataSet,newCentroids,k)

  # 将矩阵转换为列表,并排序

  centroids = sorted(newCentroids.tolist())

  # 根据质心来聚类

  cluster = []

  # 计算欧式距离

  dis_list = distance(dataSet,centroids,k)

  minDistIndices = np.argmin(dis_list,axis=1)

  for i in range(k):

  # 根据k个质心创建k个空列表,表示k个簇

  cluster.append([])

  for i,j in enumerate(minDistIndices):

  # 将dataSet中的元素分类到指定的列表中

  cluster[j].append(dataSet[i])

  return centroids,cluster

  # 数据可视化

  def visualization(dataSet,centroids):

  if column_count == 2:

  for i in range(len(dataSet)):

  plt.scatter(dataSet[i][0],dataSet[i][1],marker = 'o',color = 'blue',s = 40,label = '原始点')

  for j in range(len(centroids)):

  plt.scatter(centroids[j][0],centroids[j][1],marker = 'x',color = 'red',s = 50,label = '质心')

  plt.show()

  elif column_count == 3:

  fig = plt.figure()

  ax = Axes3D(fig)

  for i in range(len(dataSet)):

  ax.scatter(dataSet[i][0],dataSet[i][1],dataSet[i][2],marker = 'o',color = 'blue',s = 40,label = '原始点')

  for j in range(len(centroids)):

  ax.scatter(centroids[j][0],centroids[j][1],centroids[j][2],marker = 'x',color = 'red',s = 50,label = '质心')

  ax.set_zlabel('Z', fontdict={'size': 15, 'color': 'red'})

  ax.set_ylabel('Y', fontdict={'size': 15, 'color': 'red'})

  ax.set_xlabel('X', fontdict={'size': 15, 'color': 'red'})

  plt.show()

  else:

  print('数据维度过高,无法进行可视化')

  if __name__ == '__main__':

  path = input(r'请输入文件的路径:')

  dataSet,column_count = load_data(path)

  print(dataSet)

  print('-'*30,'读取成功','-'*30)

  k = int(input('请输入簇数:'))

  centroids,cluster = k_means(dataSet,k)

  print('质心为:%s'%centroids)

  print('集群为:%s'%cluster)

  visualization(dataSet,centroids)

  三.运行截图

  分别利用三维数据集和二维数据对算法进行测试

  三维数据集:大连妇科医院哪家好 https://m.120ask.com/zhenshi/dlfk/

  

数据挖掘1:K-means均值聚类算法

 

  运行结果:

  

数据挖掘1:K-means均值聚类算法

 

  二维数据集:

  

数据挖掘1:K-means均值聚类算法

 

  运行结果:

  

数据挖掘1:K-means均值聚类算法
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