input = new FileInputStream(fileName);

   Workbook wb = (Workbook) (isExcel2003 ? new HSSFWorkbook(input) : new XSSFWorkbook(fileName));

  上面的这个写法input不能close以及删除

下面这种写法即可
HSSFWorkbook wb2003 = null;
XSSFWorkbook wb2007 = null;
if(isExcel2003){
wb2003 = new HSSFWorkbook(input);
}else{
wb2007 = new XSSFWorkbook(input);
}

这是NPOI的一个死坑！！！