我正在学习python-igraph,并且难以处理分为组件(在它们之间没有连接)的图.当我在该图上应用一种聚类算法时,它似乎无法正常工作,因此我需要将算法分别应用于每个子图(组件).因此,为了保持顶点的标识,我想添加一个顶点属性,该属性在原始图中为我提供ID号.我的图是从weighted adjacency矩阵构建的：

import numpy as np
import igraph

def symmetrize(a):
    return a + a.T - 2*np.diag(a.diagonal())

A = symmetrize(np.random.random((100,100)))

G = igraph.Graph.Adjacency(A.tolist(),attr="weight",mode="UPPER")

我看到应该有一种添加vertex attributes的方法,但我不知道如何使用.

解决方法:

将顶点属性添加到所有顶点的工作原理如下：

G.vs["attr"] = ["id1", "id2", "id3", ...]

您还可以将顶点属性附加到单个顶点：

G.vs[2]["attr"] = "id3"

例如,如果仅需要所有顶点的唯一标识符,则可以执行以下操作：

G.vs["original_id"] = list(range(G.vcount()))

(如果您在Python 2.x上,则不需要list()部分,因为range()已经生成了一个列表).