在前文中,我们已经介绍过了逻辑回归算法的原理以及其python实现,具体请见逻辑回归算法及其python实现。
本文将主要介绍逻辑回归算法的R语言实现。
数据简介
本文数据选择了红酒质量分类数据集,这是一个很经典的数据集,原数据集中“质量”这一变量取值有{3,4,5,6,7,8}。为了实现二分类问题,我们添加一个变量“等级”,并将“质量”为{3,4,5}的观测划分在等级0中,“质量”为{6,7,8}的观测划分在等级1中。
因变量:等级
自变量:非挥发性酸性、挥发性酸性、柠檬酸、剩余糖分、氯化物、游离二氧化硫、二氧化硫总量、浓度、pH、硫酸盐、酒精
library(openxlsx)
wine = read.xlsx("C:/Users/Mr.Reliable/Desktop/classification/winequality-red.xlsx")
#将数据集分为训练集和测试集,比例为7:3
train_sub = sample(nrow(wine),7/10*nrow(wine))
train_data = wine[train_sub,]
test_data = wine[-train_sub,]
逻辑回归的实现
逻辑回归算法使用glm函数,family参数选择binomial即可,不需要额外下载R包。
实现逻辑回归
wine_logistic <- glm(等级 ~ 非挥发性酸性+挥发性酸性+柠檬酸+剩余糖分
+氯化物+游离二氧化硫+二氧化硫总量+浓度
+pH+硫酸盐+酒精,
data = train_data, family = "binomial")
#对逻辑回归结果进行汇总
summary(wine_logistic)
我们要根据汇总的结果提出变量,将那些p值小于0.5的变量剔除,重新运行逻辑回归算法,直到模型中的变量都是显著的。
在本例中,模型剔除了“非挥发性酸性”、“剩余糖分”、“柠檬酸”、“浓度”和“pH”。
最终的代码为:
wine_logistic <- glm(等级 ~ 挥发性酸性+氯化物+游离二氧化硫+二氧化硫总量
+硫酸盐+酒精, data = train_data, family = "binomial")
summary(wine_logistic)
汇总结果如下:
ROC曲线和AUC值
#对测试集进行预测
pre_logistic<-as.numeric(predict(wine_logistic,newdata=test_data,type="response")>0.5)
#将测试集计算所得概率与观测本身取值整合到一起
obs_p_logistic = data.frame(prob=pre_logistic,obs=test_data$等级)
#输出混淆矩阵
table(test_data$等级,pre_logistic,dnn=c("真实值","预测值"))
#绘制ROC曲线
logistic_roc <- roc(test_data$等级,pre_logistic)
plot(logistic_roc, print.auc=TRUE, auc.polygon=TRUE, grid=c(0.1, 0.2),grid.col=c("green", "red"), max.auc.polygon=TRUE,auc.polygon.col="skyblue", print.thres=TRUE,main='逻辑回归ROC曲线')